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科目

AP生物学

ヒント

AP Biology is built on four big ideas: evolution, energetics, information storage and transmission, and systems interactions. Its content is huge, but the exam does not test recall of it. It tests whether you can use biology on an unfamiliar case — a species you have never met, an experiment you have never seen.

The science practices are the real syllabus: reading a graph, designing an experiment, identifying the control, and justifying a claim with evidence. These are exactly what the free-response section asks for.

Statistics is examinable. Chi-square, standard error and error bars appear regularly, and they carry marks that pure content revision never reaches.

Notes run through all eight units, with diagrams for the processes that are easier seen than read. The library holds released free-response questions; the biology rubric pays for linking structure to function and for handling data correctly, so the worked answers are built that way.

  • 1

    生命の化学

    レッスンを視聴
    1.1

    Structure of Water and Hydrogen Bonding

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 1.1.A: 水の極性と水素結合によって生じる性質が、その生物学的機能にどう影響するかを説明する。

    • 1.1.A.1 生命体は、生命を維持するために水の性質に依存している。
      • 1.1.A.1.i 水は極性を持つ。これは、水分子内の水素と酸素の間に形成される極性共有結合によるものである。この極性は、生物体内および生物間の水素結合に寄与する。
      • 1.1.A.1.ii 水は比熱容量が高く、これにより生物体内での恒常的な体温の維持が可能となる。
      • 1.1.A.1.iii 水は気化熱が高く、これにより周囲環境の蒸発冷却が可能となる。生物体内では、この性質により体温が維持される。
    • 1.1.A.2 隣接する極性水分子間の水素結合により、凝集力、付着力、表面張力が生じる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Ice floats on water because hydrogen bonding makes solid water less dense than liquid water
    Ice floats on water because hydrogen bonding makes solid water less dense than liquid water

    Water is polar 极性: its oxygen pulls electrons more strongly than its hydrogens, giving a slightly negative O and slightly positive H. This lets water molecules form hydrogen bonds 氢键 with each other, which explains water's life-supporting properties:

    • Cohesion 内聚力 and adhesion 附着力 (surface tension, capillary action, water rising in plants),
    • high specific heat 比热容 (resists temperature change, stabilizing organisms),
    • high heat of vaporization (evaporative cooling),
    • ice floating (less dense solid), and being a great solvent for polar and ionic substances.
    A hydrogen bond between two polar water molecules
    A hydrogen bond between two polar water molecules
    探索

    Explore how a covalent bond shares electrons

    二つの原子が重なり合い、電子対を共有して各々が完全な電子殻に達するようにします。$\text{H}_2$では二つの原子が等しく引き合うため、結合は非極性となります。この対比こそが、水における不均等な共有(およびその$\delta^+/\delta^-$双極子)の重要性を生み出しています。

    English 日本語
    polar/ˈpəʊlə/ 極性
    hydrogen bonds/ˈhaɪdrədʒn bɒndz/ 水素結合
    Cohesion/kəʊˈhiːʒn/ 凝集
    adhesion/ədˈhiːʒn/ 吸着
    specific heat/spəˈsɪfɪk hiːt/ 比熱
    1.2

    Elements of Life

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 1.2.A: 生命体が必要とする高分子の組成を説明する。

    • 1.2.A.1 環境由来の原子や分子は、新しい分子を合成するために不可欠である。炭素、水素、酸素は、炭水化物、タンパク質、脂質、核酸のような生物学的分子を構成する際に最も多用される元素である。さらに:
      • 1.2.A.1.i タンパク質の合成には硫黄が使われる。
      • 1.2.A.1.ii リポソーム(脂質の一種)および核酸の合成にはリンが使われる。
      • 1.2.A.1.iii 核酸の合成には窒素が使われる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Living matter is built mostly from a few elements – carbon, hydrogen, oxygen, nitrogen, phosphorus, and sulfur. Carbon 碳 is central because it forms four stable covalent bonds, building long chains, branches, and rings – the skeletons of all biological molecules.

    Carbohydrates and fats contain carbon, hydrogen, and oxygen; proteins also contain nitrogen
    Carbohydrates and fats contain carbon, hydrogen, and oxygen; proteins also contain nitrogen
    English 日本語
    Carbon/ˈkɑːbən/ 炭素
    1.3

    Introduction to Macromolecules

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 1.3.A: 生物学的高分子を合成・分解する化学反応を説明する。

    • 1.3.A.1 加水分解とは、共有結合を切断伴随する化学反応である。この反応により、分子はより小さな分子に分解される。ポリマー内のモノマー間の結合に水が加わると、結合が切断される。水分子からの水素イオンが一つのモノマーに加えられ、水分子のヒドロキシル基がもう一つのモノマーに加えられ、反応が完了する。
    • 1.3.A.2 脱水縮合とは、2つの小さな分子が共有結合によって結びつくとき起こる。一つのモノマーから水素イオンが除去され、もう一つのモノマーからヒドロキシル基が除去される。これにより、反応物から水分子に相当する分が失われ、残りの2つのモノマーが接続される。多くのモノマーが接続されることを重合という。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Large biological molecules – macromolecules 大分子 – are polymers 聚合物 built from repeating monomers 单体. Cells join monomers by dehydration synthesis 脱水缩合 (removing water to form a bond) and break polymers by hydrolysis 水解 (adding water). Four classes: carbohydrates, lipids, nucleic acids, and proteins.

    Dehydration synthesis builds polymers and releases water; hydrolysis reverses it
    Dehydration synthesis builds polymers and releases water; hydrolysis reverses it
    探索

    単量体に基づいて4つの巨大分子のクラスを探索する

    単量体(糖、ヌクレオチド、アミノ酸)に照らして各ヒントを正しい巨大分子のクラスに分類し、脂質が真のポリマーではない例外であることを確認する。

    English 日本語
    macromolecules/ˈmækrəmɒlɪkjuːlz/ 高分子
    polymers/ˈpɒlɪməz/ ポリマー
    monomers/ˈmɒnəʊməz/ 単量体
    dehydration synthesis/ˌdiːhaɪˈdreɪʃn ˈsɪnθəsɪs/ 脱水縮合
    hydrolysis/haɪˈdrɒləsɪs/ 加水分解反応
    1.4

    Carbohydrates

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 1.4.A: 炭水化物の構造と機能について説明する。

    • 1.4.A.1 単糖(単純糖)は、多糖(複雑炭水化物)のモノマーである。これらのモノマーは共有結合によって連結され、直鎖状または分岐状となる複合炭水化物などのポリマーを形成する。
      • 1.4.A.1 の具体例:
        • セルロース
        • ストarch
        • グリコーゲン
      • 除外事項: 特定の炭水化物ポリマーの分子構造はAP試験の範囲外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Carbohydrates 碳水化合物 are made of sugar monomers (monosaccharides 单糖 like glucose). They store energy (starch, glycogen) and provide structure (cellulose 纤维素 in plant walls). Their many hydroxyl groups make them polar and water-soluble.

    The shapes of storage polysaccharides (starch, glycogen) and structural cellulose
    The shapes of storage polysaccharides (starch, glycogen) and structural cellulose
    English 日本語
    Carbohydrates/ˌkɑːbəʊˈhaɪdreɪts/ 炭水化物
    monosaccharides/ˈmɒnəʊsækɑːraɪdz/ 単糖
    cellulose/ˈseljuːləʊs/ セルロース
    1.5

    Lipids

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 1.5.A: リピッドの構造と機能について説明する。

    • 1.5.A.1 リピッドは一般的に非極性かつ親水性のない分子であり、その構造と機能は構成要素が組み合わさる方法に基づいている。脂肪酸は飽和または不飽和のいずれかに分類される。
      • 1.5.A.1.i 飽和脂肪酸は、炭素原子間の結合がすべて単結合のみである。
      • 1.5.A.1.ii 不飽和脂肪酸は、炭素原子間に少なくとも1つの二重結合を含み、これにより炭素鎖がくしれ曲がる。
      • 1.5.A.1.iii 脂肪酸尾の二重結合の数が多いほど、脂質は不飽和度が高くなる。
      • 1.5.A.1.iv 脂質の不飽和度が高いほど、室温では液体となりやすい。
    • 1.5.A.2 リピッドは生物にとって多様な機能を提供する。脂質の例として、脂肪、ステロイド(コレステロールを含む)、ホスホリPIDが含まれる。
      • 1.5.A.2.i 脂肪はエネルギー貯蔵と細胞機能の維持に寄与する。また、哺乳類の体温保持のための断熱材としても機能することがある。
      • 1.5.A.2.ii ステロイドは、成長・発育、エネルギー代謝、恒常性の維持など、生理学的機能を支援するホルモンである。
      • 1.5.A.2.iii コレステロールは動物細胞膜に不可欠な構造的安定性を提供する。
      • 1.5.A.2.iv ホスホリPIDは集合して、細胞膜や血浆膜に見られる脂質二重層を形成する。
      • 除外事項: 特定の脂質の分子構造はAP試験の範囲外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Lipids 脂质 are nonpolar and do not mix with water (hydrophobic 疏水). They include fats (long-term energy storage), phospholipids 磷脂 (which build membranes), and steroids. A phospholipid has a polar "head" and nonpolar "tails," the key to the cell membrane.

    A phospholipid has a polar head and two nonpolar tails, so phospholipids form a bilayer
    A phospholipid has a polar head and two nonpolar tails, so phospholipids form a bilayer
    A triglyceride: glycerol joined to three fatty acids
    A triglyceride: glycerol joined to three fatty acids
    English 日本語
    Lipids/ˈlɪpɪdz/ 脂質
    hydrophobic/ˌhaɪdrəˈfəʊbɪk/ 親水性
    phospholipids/ˈfɒsfəlɪpɪdz/ リン脂質
    1.6

    Nucleic Acids

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 1.6.A: DNAおよびRNAの構造と機能について説明する。

    • 1.6.A.1 核酸(DNAおよびRNA)において、生物学的情報はヌクレオチドモノマーの配列として符号化されている。各ヌクレオチドには以下の構造成分が含まれる:5炭素糖(デオキシリボースまたはリボース)、リン酸基、および窒素塩基(アデニン、チミン、グアニン、シトシン、ウラシル)。
    • 1.6.A.2 核酸は、ヌクレオチドの線形配列を持ち、末端を持つ。末端は、ヌクレオチド内の糖における3'(スリープライム)水酸基と5'(ファイブプライム)リン酸基によって定義される。核酸合成中、ヌクレオチドは伸長中の鎖の3'末端に付加され、ヌクレオチド間の共有結合が形成される。
      • 除外事項: 特定のヌクレオチドの分子構造はAP試験の範囲外である。
    • 1.6.A.3 DNAは、2本のヌクレオチド鎖が互いに反対方向の5'から3'の配向で走っている、反平行な二重らせん構造をとる。DNAでは、アデニンのヌクレオチドが水素結合によってチミンのヌクレオチドと対をなし(A-T)、シトシンのヌクレオチドが水素結合によってグアニンのヌクレオチドと対をなす(C-G)。RNAでは、アデニンはウラシルと対をなす(A-U)。
    • 1.6.A.4 DNAとRNAの構造的相違点には以下が含まれる:
      • 1.6.A.4.i DNAには糖としてデオキシリボースが含まれ、RNAには糖としてリボースが含まれる。
      • 1.6.A.4.ii DNAには窒素塩基としてチミンが含まれ、RNAには窒素塩基としてウラシルが含まれる。
      • 1.6.A.4.iii DNAは通常二本鎖であるのに対し、RNAは通常一本鎖である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Space-filling model of the DNA double helix (NHGRI)
    Space-filling model of the DNA double helix (NHGRI)

    Nucleic acids 核酸 (DNA and RNA) store and carry genetic information. Their monomers are nucleotides 核苷酸, each a sugar, a phosphate, and a nitrogen base. The base sequence encodes instructions; DNA is double-stranded, RNA single-stranded.

    Complementary base pairing holds the two antiparallel strands of DNA together
    Complementary base pairing holds the two antiparallel strands of DNA together
    探索

    相補的塩基対合を探索する

    DNAテンプレートに沿って進み、各塩基がパートナーと相補的塩基対合($A$と$T$、$G$と$C$)によって対応することを観察する——どちらの鎖もテンプレートとしてもう一方を再構築できる法则である。

    English 日本語
    Nucleic acids/njuːˈklɪɪk ˈæsɪdz/ 核酸
    nucleotides/ˈnjuːklɪɒtaɪdz/ ヌクレオチド
    1.7

    Proteins

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 1.7.A: タンパク質の構造と機能について説明する。

    • 1.7.A.1 タンパク質は、あるアミノ酸のカルボキシル基($-\text{COOH}$)と次のアミノ酸のアミノ基($-\text{NH}_2$)との間で共有結合(ペプチド結合)が形成されることで連結された、アミノ酸の直鎖状連鎖からなる。この結果、ペプチド鎖が伸長する。
    • 1.7.A.2 アミノ酸は、中央の炭素原子に水素原子、カルボキシル基、アミノ基、そして変異R基が共有結合している構造を持つ。アミノ酸のR基は、3つの化学的性質のいずれかに分類される:疎水性/非極性、親水性/極性、イオン性。これらのR基の相互作用が、タンパク質のその領域の構造と機能を決定する。
    • 1.7.A.3 タンパク質におけるアミノ酸の特定の配列は、ポリペプチドの一次構造およびタンパク質全体の形状を決定する。
      • 除外事項: アミノ酸の分子構造はAP試験の範囲外である。
    • 1.7.A.4 タンパク質の二次構造は、アミノ酸鎖のポリペプチド骨格の原子間の相互作用によって生じる局所的な折りたたみによって形成される。水素結合により、αヘリックスやβ pleated sheets(β PURATED シート)のような形状が形成される。
    • 1.7.A.5 タンパク質の三次構造の立体的形状は、水素結合、疎水性相互作用、イオン相互作用、またはジスルフィド結合の形成によって生じる。
    • 1.7.A.6 四次構造は、複数のポリペプチド間の相互作用によって生じる。タンパク質の構造のすべての4段階が、タンパク質の機能を決定する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Haemoglobin quaternary structure: four folded polypeptide chains, each holding a haem group
    Haemoglobin quaternary structure: four folded polypeptide chains, each holding a haem group

    Proteins 蛋白质 are polymers of amino acids 氨基酸 joined by peptide bonds 肽键. Their sequence folds into a specific 3-D shape at four levels (primary, secondary, tertiary, quaternary), and shape determines function – as enzymes, transporters, receptors, and structural parts. Changing the environment (heat, pH) can denature 变性 a protein, unfolding it and stopping its function.

    An amino acid, and the peptide bond formed by condensation
    An amino acid, and the peptide bond formed by condensation
    The four levels of protein structure
    The four levels of protein structure

    Worked example. Building a polymer from 10 monomers by dehydration synthesis forms 9 bonds and releases 9 water molecules — one per bond, so $N$ monomers release $N-1$ waters. Hydrolysis reverses this exactly: adding those 9 waters breaks the polymer back into 10 monomers. This is why biosynthesis (dehydration) and digestion (hydrolysis) are chemical opposites.

    English 日本語
    Proteins/ˈprəʊtiːnz/ タンパク質
    amino acids/əˈmiːnəʊ ˈæsɪdz/ アミノ酸
    peptide bonds/ˈpeptaɪd bɒndz/ ペプチド結合
    denature/ˈdenətʃə/ 変性
    1.7

    Exam tips

    • Trace every property of water back to its polarity and hydrogen bonding (cohesion, high specific heat, solvent power).
    • Know the four macromolecule classes and their monomers; polymers are built by dehydration synthesis and broken by hydrolysis.
    • For proteins, structure (shape) determines function — heat or a pH change denatures them and stops them working.
    • In DNA the bases pair A–T and C–G on antiparallel strands; RNA is single-stranded and uses U.
    • Link each molecule to its role (carbohydrates: energy/structure; lipids: membranes/storage; nucleic acids: information).
  • 2

    細胞の構造と機能

    レッスンを視聴
    2.1

    小器官と内膜系

    シラバス

    Big Idea 4 — システム間相互作用 (SYI): 生物学的システムは相互作用し、それらのシステムおよび相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 2.1.A: 細胞小器官の構造と機能、およびサブセルラーコンポーネントが細胞の機能にどのように寄与するかを説明する。

    • 2.1.A.1 リボソームはリボソームRNA (rRNA) とタンパク質で構成されている。これらの膜を持たないサブセルラー構造物は、あらゆる生命体の細胞に存在し、既知の全生命体の共通の系統性を反映している。リボソームはメッセンジャーRNA (mRNA) の配列に従ってタンパク質を合成する。
    • 2.1.A.2 内膜系は、膜に囲まれた小器官およびサブセルラーコンポーネント(内質網 (ER)、ゴルジ装置、ライソソーム、液胞、輸送小胞体、核膜、細胞膜)のグループからなり、これらは協調して多糖類、脂質、タンパク質を細胞間で修飾、包装、輸送する役割を果たす。
    • 2.1.A.3 内質網は、細胞が形を維持するのを助けることで機械的支援を提供し、細胞内輸送にも関与する。
      • i. 粗面内質網は膜付着リボソームに関係しており、細胞の区画化を可能にし、タンパク質合成の実行を助ける。
      • ii. 滑面内質網の機能には、細胞の解毒作用と脂質の合成が含まれる。
      • 除外事項: 特化した細胞における滑面内質網の特定の機能に関する知識はAP試験の範囲外である。
    • 2.1.A.4 ゴルジ装置は、一連の扁平な膜嚢からなる膜に囲まれた構造物である。ゴルジの機能には以下が含まれる:
      • i. 新しく合成された細胞産物の正しい折りたたみと化学的修飾
      • ii. 輸送用タンパク質の包装
      • 除外事項: 特定のホスホリピッドの合成や、ライソソーム、ペルオキシソーム、分泌小胞体への特定の酵素の包装におけるゴルジの役割に関する知識はAP試験の範囲外である。
      • 2.1.A.4の例示:
        • ゴルジ内で起こるタンパク質のグリコシル化や他の化学的修飾であり、これらがタンパク質の機能や標的決定に寄与する
    • 2.1.A.5 ミトコンドリアは二重膜を持ち、好気性細胞呼吸に関わる異なる代謝反応のための区画を提供する。外膜は滑らかであるのに対し、内膜は極めて湾曲しており、ATPをより効率的に合成できるような褶(しわ)を形成している。
    • 2.1.A.6 ライソソームは加水分解酵素を含み、物質を消化する膜に囲まれた嚢である。ライソソームはプログラム細胞死(アポトーシス)にも関与する。
    • 2.1.A.7 液胞は膜に囲まれた嚢であり、多様な役割を果たす。
      • i. 植物細胞では、特殊化した大型の液胞が栄養素と水の貯蔵を通じて膨圧を維持する。
      • ii. 動物細胞では、液胞はサイズが小さく、植物細胞よりも豊富に存在し、細胞内の物質を貯蔵する。
    • 2.1.A.8 クロロプラストは、植物と光合成藻類に存在する特殊化した小器官である。クロロプラストは二重膜を持ち、光合成が行われる場所として機能する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    緑色の葉緑体で満たされたエロデア葉細胞(光学顕微鏡写真)
    緑色のクロロプラストに満たされたエロデア葉の細胞(光顕微鏡写真)
    光顕微鏡下での玉ねぎ表皮細胞 — 細胞壁と核がはっきり見える
    光顕微鏡下での玉ねぎ表皮細胞 — 細胞壁と核がはっきり見える

    真核細胞は、小器官(オルガネラ) に仕事を分担している。内膜系は、分子を合成・修飾・輸送する相互に接続したシステムであり、核(DNAを保持)、粗面小胞体および滑面小胞体(タンパク質および脂質の合成)、ゴルジ装置(修飾および包装)、リソソーム(消化)、そしてそれら間で物質を運ぶ小胞を含む。ミトコンドリア(呼吸)とクロロプラスト(光合成)は独自の膜を持つ。

    植物細胞には細胞壁、大きな液胞、クロロプラストもある
    植物細胞には細胞壁、大きな液胞、クロロプラストもある
    一般的な動物細胞とその小器官
    一般的な動物細胞とその小器官

    各小器官の実際の機能

    試験では構造名とその機能を答える必要があるため、ペアとして覚えること。

    リボソームはリボソームRNA(rRNA)とタンパク質からなる。膜を持たず、すべての生命形態に存在する — 細菌、古細菌、真核生物 alike。この共通する存在は共通祖先の証拠である:これほど中心的な構造は、あらゆる生物の最終共通祖先においてすでに存在していた。リボソームはメッセンジャーRNA(mRNA)を読み取り、そのコードするタンパク質を合成する。遊離リボソームは細胞内で使われるタンパク質を製造し、粗面小胞体に結合したリボソームは輸出用または膜用タンパク質を製造する。

    ゴルジ複合体は、扁平で膜に包まれた嚢の連なりである。小胞体から届いたタンパク質通过这些 them,以下3つのことが起こる:

    • 正しく折りたたまれ、化学的に修飾される — 最も一般的には糖鎖付加(短い糖鎖の結合)により;
    • 選別され標的付けられ、修飾された糖やリン酸タグがタンパク質を送る区画を決定する;
    • 輸送用の小胞にパッケージされる。

    したがってゴルジは貯蔵ではなく、細胞の仕上げおよび発送部門であり、その修飾がタンパク質の機能と最終的な場所を決定する。

    リソソームは加水分解酵素に満たされた膜に包まれた嚢であり、物質を消化する — 使い古された小器官、捕食された細菌、細胞によって摂取された食物粒子。これらの酵素は低いpHで最も良く機能するため、リソソームは内部を低pHに保っている;これらを膜に包むことで他の細胞成分を保護している。リソソームはアポトーシス(プログラム細胞死)にも関与しており、これは意図的に解体されるプロセスであり、例えば指を形成するために-webbed embryonic hand を造形する場合などがある。

    液胞は膜に包まれた嚢であり、多様な役割を持つ:水、イオン、栄養素、廃棄物の貯蔵、植物細胞では中央の大きな液胞が細胞壁 outward に押し付けて細胞を硬く保つ。

    ミトコンドリアとクロロプラストはそれぞれ二重膜を持ち、自身の環状DNAとリボソームを持っている — これらは後述の内共生説の根拠である。

    2.2

    細胞が小さい理由

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.2.A: 表面積対体積比が、細胞または生物体と環境との間の物質交換に及ぼす影響を説明する。

    • 2.2.A.1 表面積対体積比は、生物系が必要とする栄養素を得たり、廃棄物を排除したり、熱エネルギーを取得または散逸させたり、その他環境との化学物質およびエネルギーの交換を行う能力に影響を与える。
      • 関連式:
        • 球の体積: $V = \dfrac{4}{3}\pi r^3$
        • 立方体の体積: $V = s^3$
        • 直方体の体積: $V = lwh$
        • 円柱の体積: $V = \pi r^2 h$
        • 球の表面積: $SA = 4\pi r^2$
        • 立方体の表面積: $SA = 6s^2$
        • 直方体の表面積: $SA = 2lh + 2lw + 2wh$
        • 円柱の表面積: $SA = 2\pi rh + 2\pi r^2$
        • $r$ = 半径
        • $l$ = 長さ
        • $h$ = 高さ
        • $w$ = 幅
        • $s$ = 立方体の1辺の長さ
      • 2.2.A.1の例示:
        • SA/V比と交換
          • 根毛
          • 保衛細胞
          • 腸上皮細胞
        • 繊毛
        • 気孔
    • 2.2.A.2 細胞膜の表面積は、物質を適切に交換するために十分な大きさである必要がある。
      • i. 表面積対体積比は細胞サイズと形状を制限することがある。小さい細胞は通常、大きい細胞よりも高い表面積対体積比を持ち、環境との物質交換もより効率的である。
      • ii. 細胞の体積が増加すると、表面積対体積比は減少し、内部資源への需要が増加する。
      • iii. 環境との物質交換を適切に行うためには、複雑な細胞構造(例:膜の折り目など)が必要である。
      • iv. 生物のサイズが増大すると、表面積と体積の比が減少し、環境との熱交換速度などの性質に影響を与える。大きな質量よりも、小さな質量の方が相対的に環境との熱交換量が多い。質量が増加すると、表面積と体積の比および熱交換速度の両方が減少する。
      • v. 単位体重あたりの代謝率と多細胞生物のサイズの間には関係があり、一般的に、生物が小さいほど単位体重あたりの代謝率は高い。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    赤血球の走査型電子顕微鏡写真 — 核なし、ガス交換のための高い表面積
    赤血球の走査型電子顕微鏡写真 — 核なし、ガス交換のための高い表面積

    細胞が小さいのは表面積対体積比のためである。細胞が大きくなると体積は表面積よりも速く増加するため、膜は内部に対して十分な速度で物質を交換できない。小さく保つ(あるいは平らにする、折りたたむ)ことで、体積に対応する十分な表面積を維持できる。

    細胞が大きくなるにつれて表面積対体積比は低下する
    細胞が大きくなるにつれて表面積対体積比は低下する

    計算例。 一辺が$2\ \mu\text{m}$の立方体の細胞は、表面積が$6\times2^2=24\ \mu\text{m}^2$、体積が$2^3=8\ \mu\text{m}^3$であるため、表面積対体積比は$\tfrac{24}{8}=3$となる。一辺を$4\ \mu\text{m}$に倍増させると、表面積は$=6\times4^2=96$、体積は$=4^3=64$、比は$=\tfrac{96}{64}=1.5$となる。サイズを倍増させたことで比は半分になった——より大きな細胞は内部単位あたりの膜がはるかに少ないため、細胞は小さく保たれる。

    探索

    立方体が成長するにつれて表面積と体積の関係を見る

    細胞が成長すると、体積は表面積よりも速く増加するため、表面積対体積比は低下する。小さな細胞は十分な膜を持ち、物質交換を十分に速く行える。

    2.3

    膜の流動モザイクモデル

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.3.A: 細胞膜を構成する各成分が、細胞内部環境を維持する上で果たす役割を説明すること。

    • 2.3.A.1 リポイドには親水性部分と疎水性部分の両方がある。リポイドの極性のある親水性リン酸部分は、水溶液である外部または内部環境に向き合っている。一方、非極性のある疎水性脂肪酸部分は、膜の内部で互いに向き合っている。
    • 2.3.A.2 埋め込まれたタンパク質は、親水性(電荷を持つ極性側基を含む)、疎水性(非極性側基を含む)、あるいはその両方の特性を持つことがある。
      • i. タンパク質の親水性部分は、タンパク質の内部にあるか、細胞質(シトゾール)に露出している。
      • ii. タンパク質の疎水性部分は、膜の内部にある脂肪酸と相互作用するタンパク質の表面を形成する。

    学習目標 2.3.B: 細胞膜の流動モザイクモデルを説明すること。

    • 2.3.B.1 プラズマ膜は、脂質二重層を骨格とし、タンパク質、ステロイド(脊椎動物ではコレステロールなど)、グリコプロテイン、グリコリピッドが埋め込まれた構造から成る。これらの成分はすべて、流動モザイクモデルに示されるように、膜内で細胞表面を移動することができる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    細胞膜はホスファチジバイレイヤー — 親水性頭部が水に向かい、疎水性尾部が内側にある — タンパク質で埋め込まれている。流動モザイクモデルは、脂質とタンパク質が漂う流体シートとして描く。コレステロールと不飽和度の度合いが流動性を調整する。

    細胞膜の流動モザイクモデル
    細胞膜の流動モザイクモデル
    2.4

    膜を通過できるもの

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.4.A: 生物膜の構造が選択的透過性に与える影響について説明すること。

    • 2.4.A.1 プラズマ膜は細胞の内部環境と外部環境を分離している。選択的透過性は、プラズマ膜が疎水性の内部を持っていることに起因する。
    • 2.4.A.2 小さな非極性分子である $\mathrm{N_2}$、$\mathrm{O_2}$、$\mathrm{CO_2}$ は膜を自由に通過する。親水性物質(大きな極性分子やイオンなど)は、埋め込まれたチャネルや輸送タンパク質を通じて膜を移動する。
    • 2.4.A.3 リポイドの非極性炭化水素鎖は、イオンや極性分子の膜透過を妨げる。小さな極性かつ電荷を持たない分子($\mathrm{H_2O}$ や $\mathrm{NH_3}$(アンモニア)など)は、少量ながら膜を通過する。

    学習目標 2.4.B: 細胞壁が細胞の構造と機能の維持に果たす役割を説明すること。

    • 2.4.B.1 細菌、古菌、真菌、植物の細胞壁は、構造的境界として機能するとともに、特定の物質に対する透過性バリアとなり、細胞内外の環境への保護や浸透圧による破裂(オスモリス)からの防御を提供する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    膜は選択透過性を持つ。小さな非極性分子($\text{O}_2$, $\text{CO}_2$)と水は容易に通過する;大きな粒子や電荷/極性を持つ粒子(イオン、ブドウ糖)は、非極性コアを通過できない(助けが必要)。この選択性が細胞に内部環境を制御させる。

    物質が膜を通過する3つの方法
    物質が膜を通過する3つの方法
    2.5

    受動輸送と能動輸送

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.5.A: 生物が溶質と水のバランスを維持するために用いるメカニズムを説明すること。

    • 2.5.A.1 膜の選択的透過性により、溶質の濃度勾配が膜の両側に形成される。
    • 2.5.A.2 受動輸送とは、代謝エネルギーの直接的な投入なしに、高濃度領域から低濃度領域へ分子が正味で移動するプロセスである。
    • 2.5.A.3 能動輸送は、分子を移動させるためにエネルギーの直接的な投入を必要とする。場合によっては、能動輸送によって低濃度領域から高濃度領域へ分子を移動させることもある。

    学習目標 2.5.B: 生物が大きな分子をプラズマ膜を越えて輸送するために用いるメカニズムを説明すること。

    • 2.5.B.1 エンドサイトーシスとエキソサイトーシスのプロセスには、大きな物質や大量の物質を細胞内・外へ出入りさせるためにエネルギーが必要である。
      • i. エンドサイトーシスでは、細胞はプラズマ膜を自身の方へ折り曲げて新しい(小さな)小胞を形成し、外部環境からの物質を取り込む。
      • ii. エキソサイトーシスでは、細胞内の小胞がプラズマ膜と融合して、大きな分子を細胞外へ分泌する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    • 受動輸送は物質を濃度勾配 沿い (高 → 低)に移動させ、エネルギーを要しない — 拡散。
    • 能動輸送は物質を勾配 逆 (低 → 高)に移動させ、エネルギー(ATP)を必要とし、ナトリウム-カリウムポンプなどのタンパク質ポンプを介して行われる。
    能動輸送は粒子を勾配逆へ移動させ、ATPとキャリアタンパク質を使用する
    能動輸送は粒子を勾配逆へ移動させ、ATPとキャリアタンパク質を使用する
    探索

    濃度勾配に逆らって溶質をポンプする

    受動輸送は溶質を勾配に従って無費で移動させ、能動輸送はATPを使ってそれらを低濃度から高濃度へ逆向きにポンプする。

    English 日本語
    Active transport/ˈæktɪv ˈtrænspɔːt/ 能動的輸送
    Facilitated diffusion/fəˈsɪlɪteɪtɪd dɪˈfjuːʒn/ 促進拡散
    carrier/ˈkærɪə/ キャリア
    Osmosis/ɒzˈməʊsɪs/ 浸透
    Tonicity/təˈnɪsɪti/ 浸透圧
    hypotonic/ˌhaɪpəʊˈtɒnɪk/ 低張性
    hypertonic/ˌhaɪpəˈtɒnɪk/ 高張性
    isotonic/ˌaɪsəˈtɒnɪk/ 等張
    Water potential/ˈwɔːtə pəˈtenʃl/ 水分ポテンシャル
    Osmoregulation/ˌɒzmɔːɡjʊˈleɪʃn/ 浸透圧調節
    endocytosis/ˌendəʊsɪˈtəʊsɪs/ 食胞作用
    2.6

    促進拡散

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.6.A: 分子の構造がプラズマ膜を通過する能力に与える影響について説明すること。

    • 2.6.A.1 促進拡散には、電荷を持つイオンの膜透過を可能にするための輸送タンパク質またはチャネルタンパク質が必要である。
      • i. イオンの膜透過によって、膜が分極することがある。
      • ii. 電荷を持つイオン($\mathrm{Na^+}$(ナトリウム)や $\mathrm{K^+}$(カリウム)など)は、膜を通過するためにチャネルタンパク質を必要とする。
    • 2.6.A.2 促進拡散は、エネルギー投入なしに大きな極性分子を膜を通過させることを可能にする。この種の拡散において、物質は濃度勾配に沿って移動する。
    • 2.6.A.3 アクアポーリンは、膜を越えて大量の水を輸送する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    促進拡散は、膜タンパク質(チャネルまたはキャリア)を介した受動輸送であり、脂質二重層のみでは通過できない粒子に対して機能します。濃度勾配に従って移動するためエネルギーは必要ありませんが、すべてのタンパク質が飽和状態になると速度は頭打ちになります。

    拡散:粒子は濃度の高い場所から低い場所へ、勾配に沿って広がる
    拡散:粒子は濃度の高い場所から低い場所へ、勾配に沿って広がる
    English 日本語
    organelles/ˌɔːɡəˈnelz/ 小器官
    endomembrane system/ˈendəʊmembreɪn ˈsɪstəm/ 内膜系
    nucleus/ˈnjuːklɪəs/ 核
    endoplasmic reticulum/ˌendəʊˈplæzmɪk reˈtɪkjʊləm/ 小胞体
    Golgi/ˈɡɒlɡɪ/ ゴルジ
    lysosomes/ˈlaɪsəsəʊmz/ ライソソーム
    Mitochondria/ˌmaɪtəˈkɒndrɪə/ ミトコンドリア
    chloroplasts/ˈklɔːrəʊplæsts/ 葉緑体
    Ribosomes/ˈrɪbəsəʊmz/ リボソーム
    ribosomal RNA/ˈrɪbəsɒml ˌɑː en ˈeɪ/ リボソームRNA
    messenger RNA/ˈmesɪndʒə ˌɑː en ˈeɪ/ メッセンジャーRNA
    The Golgi complex/ðə ˈɡɒlɡɪ ˈkɒmpleks/ ゴルジ装置
    glycosylation/ˌɡlaɪkəsɪˈleɪʃn/ 糖鎖付加
    hydrolytic enzymes/ˌhaɪdrəˈlɪtɪk ˈenzaɪmz/ 加水分解酵素
    apoptosis/əpəpˈtəʊsɪs/ アポトーシス
    Vacuoles/ˈvækjuːəʊlz/ 液胞
    surface-area-to-volume ratio/ˈsɜːfɪs ˈeərɪə tə ˈvɒljuːm ˈreɪʃɪəʊ/ 表面積対体積比
    phospholipid bilayer/ˈfɒsfəlɪpɪd ˈbɪleɪə/ ホスホリピッド二重層
    fluid mosaic model/ˈfluːɪd məˈseɪɪk ˈmɒdl/ 流動モザイクモデル
    selectively permeable/sɪˈlektɪvli ˈpɜːməbl/ 選択透過性
    Passive transport/ˈpæsɪv ˈtrænspɔːt/ 受動輸送
    diffusion/dɪˈfjuːʒn/ 拡散
    2.7

    浸透圧、ポテンシャル水位、および浸透調節

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.7.A: 濃度勾配が膜を越えた分子の移動に与える影響について説明すること。

    • 2.7.A.1 外部環境は、細胞の内部環境に対して低張性、高張性、または等張性であることができる。水の移動もまた、低張性領域から高張性領域へ向かうものと記述できる。水は浸透によって高い水ポテンシャルの領域から低い水ポテンシャルの領域へ移動する。
      • 式(水ポテンシャル): $\psi = \psi_p + \psi_s$
        • ここで:
        • $\psi_p$ = 圧力ポテンシャル
        • $\psi_s$ = 溶質ポテンシャル
      • 例: 2.7.A.1:
        • 原生生物の収縮液胞
        • 植物細胞の中心液胞

    学習目標 2.7.B: 浸透調節メカニズムが生物の健康と生存にどのように寄与するかを説明する。

    • 2.7.B.1 成長とホメオスタシスは、分子が膜を通過する持続的な移動によって維持される。
    • 2.7.B.2 浸透調節は水分バランスを維持し、生物が内部の溶質組成とポテンシャルを制御できるようにする。水は低浸透圧または低溶質濃度から高浸透圧または高溶質濃度の領域へ移動する。
      • 数式(溶液の溶質ポテンシャル): $\psi_s = -iCRT$
        • ここで:
        • $i$ = 電離定数
        • $C$ = モル濃度
        • $R$ = 圧力が一定 $\left(R = 0.0831 \dfrac{L \cdot bars}{mol \cdot K}\right)$
        • $T$ = ケルビン温度 (°C + 273)

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    高張溶液における赤玉ねぎ細胞:膜が壁から引き離される(塑性分離)
    高張溶液における赤玉ねぎ細胞:膜が壁から引き離される(塑性分離)

    浸透とは、水分子が膜を通過して拡散する現象です。浸透圧は溶質濃度を比較する指標です:低張溶液中では細胞は水分を吸収し(破裂する可能性があります)、高張溶液中では水分を失い(収縮する)、等張溶液中では正味の変化はありません。ポテンシャル水位は水の移動方向を予測します(水は低いポテンシャル水位の方向へ移動)。これは圧力項と溶質項の和として表され、式 $\Psi=\Psi_p+\Psi_s$ で示されます。ここで溶質ポテンシャル $\Psi_s=-iCRT$ です。浸透調節とは、生物がこのバランスを制御する方法を指します。

    異なる水ポテンシャルの溶液に対する植物細胞と動物細胞の反応
    異なる水ポテンシャルの溶液に対する植物細胞と動物細胞の反応

    ** worked example.** $0.1\,\text{M}$ のスクロース溶液($i=1$)が開いたビーカー内(圧力ポテンシャル $\Psi_p=0$)で、温度 $25\,°\text{C}$ ($T=298\,\text{K}$, $R=0.0831\ \text{L}\cdot\text{bar/mol}\cdot\text{K}$)にある場合:$\Psi_s=-iCRT=-(1)(0.1)(0.0831)(298)\approx-2.48\ \text{bar}$ となるため、$\Psi\approx-2.48\ \text{bar}$ となります。内部が $\Psi=-1.0\ \text{bar}$ の植物細胞がこの溶液に置かれると、溶液の方がより負の値であるため、水は細胞から排出されて溶液側へ移動し、細胞は膨圧を失います。

    探索

    浸透による水の移動を見る

    水は膜を高い水ポテンシャルから低い方へ、より濃度が高い(高張)側へ移動する。濃度を設定して、細胞が膨張するか収縮するかを見る。

    2.8

    膜輸送のメカニズム

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.8.A: イオンやその他の分子が膜を通過して移動するプロセスを説明する。

    • 2.8.A.1 分子の能動輸送および電気化学勾配の形成・維持には、代謝エネルギー(ATP由来など)が必要である。
      • i. 能動輸送には膜タンパク質が必要である。
      • ii. $\mathrm{Na^+}/\mathrm{K^+}$ポンプとATPアーゼは膜電位の維持に寄与する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    大きな物質は小胞体による塊での移動(bulk transport)によって運ばれます:エンドサイトーシスは物質を取り込む過程(膜が物質を包み込みます)、エキソサイトーシスは物質を放出する過程(小胞体が膜と融合します)です。どちらもエネルギーを必要とし、細胞が巨大な分子を取り込み・分泌することを可能にします。

    エンドサイトーシスは物質を取り込み、エキソサイトーシスは外部へ放出する
    エンドサイトーシスは物質を取り込み、エキソサイトーシスは外部へ放出する
    English 日本語
    exocytosis/eɡˌzɒsɪˈtəʊsɪs/ 分泌作用
    compartments/kəmˈpɑːtmənts/ 区画
    endosymbiotic theory/ˌendəʊˌsɪmbaɪˈɒtɪk ˈθɪəri/ 内共生説
    ribosomal RNA (rRNA)/ˈrɪbəsɒml ˌɑː en ˈeɪ/ リボソームRNA (rRNA)
    2.9

    細胞内の区画化

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学 (ENE): 生物系はエネルギーおよび分子構築材料を用いて、成長、繁殖、動的恒常性の維持を行う。

    学習目標 2.9.A: 真核細胞の膜結合構造を説明する。

    • 2.9.A.1 真核細胞における膜および膜結合小器官は、細胞内代謝プロセスや特定の酵素反応を区画化する。

    学習目標 2.9.B: 内部膜および膜結合小器官が真核細胞の機能の区画化にどのように寄与するかを説明する。

    • 2.9.B.1 内部膜は競合する相互作用を最小限に抑え、反応が起こる表面積を増やすことで、細胞プロセスを促進する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    膜は互いに干渉しない反応を同時に進行させ、条件(pHやイオン濃度など)を局所的に調整できる独立した区画を形成しています。この組織化により効率が向上し、内部膜は反応のための表面積も増やします。

    2.10

    細胞区画化の起源

    シラバス

    Big Idea 1 — 進化 (EVO): 進化のプロセスが生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 2.10.A: 原核細胞と真核細胞の間の区画化の類似点および/または相違点を記述する。

    • 2.10.A.1 ミトコンドリアやクロロプラストなどの膜付着小器官は、内生共生によってかつて自由生活していた原核細胞から進化した。
    • 2.10.A.2 原核生物は通常、内部の膜付着小器官を持たないが、特殊な構造と機能を持つ内部領域を持っている。
    • 2.10.A.3 真核細胞は、細胞を特殊化した領域に区画化する内部膜を維持している。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    共生説はミトコンドリアと葉緑体の起源を説明しており、これらは大型細胞が自由生活する原核生物を取り込み、その内部に定着した結果生じたと考えられています。独自の環状DNA、独自のリボソーム、二重膜という証拠は、これらの共通の進化的起源を裏付けています。

    2.10

    試験対策

    • AP試験形式の2つのスキルを用いること:表面積対体積比(細胞が小型である理由)とポテンシャル水位 $\Psi=\Psi_p+\Psi_s$ ($\Psi_s=-iCRT$)。
    • 水は低い(より負の)ポテンシャル水位の方向へ移動します。浸透圧(低張・高張・等張)に基づいて膨潤または収縮を予測すること。
    • 受動輸送と浸透はエネルギーを要せず(濃度勾配に従う)、能動輸送はATPを必要とする(濃度勾配に逆らう)。
    • 拡散、促進拡散(チャネル/キャリアタンパク質を伴う)、能動輸送を区別すること。
    • ホスホリピド二重層からの膜の選択的透過性を説明すること。小さな非極性分子は通過できるが、大きい分子や電荷を持つ分子は補助が必要である。
  • 3

    細胞エネルギー代謝

    レッスンを視聴
    3.1

    酵素による生体触媒作用

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 3.1.A: 酵素が生物反応の速度にどう影響するかを説明する。

    • 3.1.A.1 酵素の構造と機能は生物プロセスの調節に寄与する。酵素は活性化エネルギーを低下させることで細胞内の化学反応を促進する生体触媒であるタンパク質である。
    • 3.1.A.2 酵素を介した化学反応が起こるためには、基質の形状と電荷が酵素の活性部位と互換性でなければならない。これは酵素-基質複合体モデルによって示される。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    生物系洗剤は適温・適pHで働く酵素を使用している
    生物系洗剤は適温・適pHで働く酵素を使用している

    酵素とは、活性化エネルギーを下げることで反応速度を速めるタンパク質触媒であり、自身は消費されません。各酵素には特定の基質(「鍵と錠前」モデルまたは誘導適合モデル)に結合する活性部位があり、非常に高い特異性を持ちます。酵素は反応の熱力学的有利性を変化させるわけではなく、単に反応速度を変化させます。

    酵素は反応の活性化エネルギーを下げる
    酵素は反応の活性化エネルギーを下げる
    酵素作用の鍵と錠前モデルおよび誘導適合モデル
    酵素作用の鍵と錠前モデルおよび誘導適合モデル
    探索

    基質を増やして反応速度の飽和を見る

    酵素は活性化エネルギーを下げることで反応を加速させる。基質が増加すると速度は上昇するが、すべての活性部位が使われ饱和すると水平になる。

    English 日本語
    enzyme/ˈenzaɪm/ 酵素
    catalyst/ˈkætəlɪst/ 触媒
    activation energy/ˌæktɪˈveɪʃn ˈenədʒi/ 活性化エネルギー
    active site/ˈæktɪv saɪt/ active site(活性部位)
    substrate/ˈsʌbstreɪt/ substrate(基質)
    denatures/ˈdenətʃəz/ 変性する
    Inhibitors/ɪnˈhɪbɪtəz/ 阻害剤
    The first law/ðə fɜːst lɔː/ 第一法則
    The second law/ðə ˈsekənd lɔː/ 第二法則
    entropy/ˈentrəpi/ エントロピー
    constant input of free energy/ˈkɒnstənt ˈɪnpʊt ɒv friː ˈenədʒi/ 自由エネルギーの一定供給
    Photosynthesis/ˌfəʊtəʊˈsɪnθəsɪs/ 光合成
    Calvin cycle/ˈkælvɪn ˈsaɪkl/ カルビン回路
    prokaryotes/ˈprɒkərɪəʊts/ 原核生物
    cyanobacteria/ˌsaɪəˌnɒbəkˈtɪərɪə/ シアノバクテリア
    oxygenated atmosphere/ˈɒksɪdʒeneɪtɪd ˈætməsfɪə/ 酸素大気
    banded iron formations/ˈbændɪd ˈaɪən fɔːˈmeɪʃnz/ 層状鉄鉱床
    Cellular respiration/ˈseljʊlə ˌrespɪˈreɪʃn/ 細胞呼吸
    Glycolysis/ɡlaɪˈkɒləsɪs/ 糖解系
    Krebs cycle/krebz ˈsaɪkl/ クレブス回路
    electron transport chain/ɪˈlektrɒn ˈtrænspɔːt tʃeɪn/ 電子伝達系
    fermentation/fɜːmənˈteɪʃn/ 発酵
    3.2

    環境要因による酵素機能への影響

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 3.2.A: 酵素の構造の変化がその機能にどう影響するかを説明する。

    • 3.2.A.1 酵素系構成要素の分子構造の変化は、その機能や効率の変化をもたらすことがある。
      • i. 温度、pH、または化学環境の変化によりタンパク質構造が破壊され、反応触媒能力が失われるとき、酵素などのタンパク質の変性が起こる。
      • ii. 特定の酵素にとって最適範囲外の環境温度やpHは、水素結合の破壊によりその構造を変化させ、反応触媒効率を変える。
    • 3.2.A.2 場合によっては酵素の変性が可逆であり、酵素が活性を取り戻すことができる。

    学習目標 3.2.B: 細胞環境が酵素活性にどう影響するかを説明する。

    • 3.2.B.1 基質と生成物の相対濃度は、酵素反応がどれだけ効率的に進むかを決定する。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    酵素活性は環境条件に依存します。各酵素には最適な温度とpHがあり、それを超えるとタンパク質は変性(形状を失う)して機能を停止します。基質濃度は酵素が飽和するまで反応速度を上昇させます。阻害剤は酵素の働きを遅くします。競合的阻害剤は活性部位をブロックし、非競合的阻害剤は他の部位に結合して形状を変化させます。

    各酵素には最適なpHがある
    各酵素には最適なpHがある
    反応速度は最適温度まで上昇し、その後酵素の変性によって低下する
    反応速度は最適温度まで上昇し、その後酵素の変性によって低下する
    探索

    温度を変化させて酵素活性を見る

    各酵素には最適温度とpHがある。寒すぎると遅くなり、暑すぎると酵素が変性して活性部位の形状を失い、活性は急落する。

    3.3

    細胞エネルギーとATP

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 3.3.A: 生命体におけるエネルギーの役割を説明する。

    • 3.3.A.1 全ての生命系にはエネルギーの投入が必要である。
    • 3.3.A.2 生命は高度に秩序立ったシステムを必要とし、熱力学第一法則および第二法則を違反しない。
      • i. 秩序を維持し細胞プロセスを駆動するためには、エネルギー投入がエネルギー損失を上回っている必要がある。
      • ii. エネルギーを放出する細胞プロセスは、エネルギーを必要とする細胞プロセスと連動することがある。
      • iii. 秩序やエネルギー流の著しい喪失は死につながる。
      • 除外事項: 学生はエネルギーの概念を理解する必要があるが、ギブズ自由エネルギーの数式はAP試験の範囲外である。
    • 3.3.A.3 生物系におけるエネルギー関連経路は順列であるため、より統制的なエネルギー転移が可能である。代謝経路内の反応の生成物は通常、経路の次のステップの反応物となる。

    学習目標 3.3.B: 共有され、保存され、基礎的なプロセスや特徴が、全ての生物の共通祖先という概念をどう支えているかを説明する。

    • 3.3.B.1 核心的な代謝経路(例:解糖系、酸化的リン酸化)は、現在認められているすべてのドメイン(古細菌、細菌、真核生物)にわたって保存されている。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    ATP(アデノシン三リン酸)は細胞内のエネルギー通貨です。エネルギーはリン酸結合に蓄えられており、リン酸が切り離される(ATP → ADP)ことでエネルギーが遊離され細胞作業驱动力となり、逆に結合することでエネルギーが蓄積されます。細胞は常にATPをリサイクルしており、エネルギーを放出する反応とエネルギーを消費する反応を連結しています。

    ATP-ADPサイクルはエネルギーの蓄積と遊離を行う
    ATP-ADPサイクルはエネルギーの蓄積と遊離を行う

    生命と熱力学の法則

    生きた細胞は極めて秩序だった構造を持っていますが、それが物理法則の違反であると誤解されることがあります。実際にはそうではありません。

    • 第一法則はエネルギー保存則を示す:形は変わるが創造も破壊もしない。細胞はエネルギーを生み出すのではなく、グルコースの化学エネルギーや太陽の光エネルギーをATPの化学エネルギーへ変換する。
    • 第二法則は、どのエネルギー移動においても熱としてエネルギーの一部が失われ、宇宙のエントロピーが増大することを示す。細胞は内部に秩序を形成するが、それは主に熱として環境により大きな無秩序を放出することで達成される。

    したがって、生命は外部からの自由エネルギーの継続的な供給を必要とします。これが、エネルギー源から遮断された個体が死に至る理由です。秩序を維持することは無償ではなく、供給が止まれば有序系は崩壊します。

    3.4

    光合成

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 3.4.A: 生物がエネルギーを捕獲・貯留できる光合成のプロセスおよび葉緑体の構造的特徴を説明する。

    • 3.4.A.1 光合成は、炭酸ガス $(\mathrm{CO_2})$、水 $(\mathrm{H_2O})$、および光エネルギーを用いて炭水化物と酸素 $(\mathrm{O_2})$を生成する一連の反応である。
      • i. 光合成生物は太陽からのエネルギーを捕獲し、生物プロセスで使用したり貯蓄したりできる糖を産生する。
      • ii. 光合成は最初に原核生物において進化した。
      • iii. 原核生物(シアノバクテリア)の光合成が酸素を含む大気の形成をもたらしたという主張は、科学的証拠によって支持されている。
      • iv. 原核生物の光合成経路は、真核生物の光合成の基盤となった。
      • 除外事項: カルビン回路のプロセス、分子の構造、関連酵素の名前の暗記はAP試験の範囲外である(ATP合成酵素を除く)。
    • 3.4.A.2 ストロマとチラコイドは、葉緑体内部に存在する。
      • i. ストロマとは、葉緑体の内膜の内側かつチラコイドの外側にある液状部分である。光合成の炭素固定(カルビン回路)反応はストロマ内で起こる。
      • ii. チラコイド膜には、2つの光系に組織化されたクロロフィル色素および電子輸送タンパク質が含まれる。
      • iii. チラコイドはグラナと呼ばれる層状構造を形成している。光合成の光反応はグラナで起こる。
    • 3.4.A.3 真核生物の光合成における光反応は、光に含まれるエネルギーを捕獲してATPとNADPHを生成し、これらがカルビン回路での有機物産生を駆動する、一連の調整された反応経路を伴う。これにより代謝プロセスに必要なエネルギーが供給される。

    学習目標 3.4.B: 細胞が光からエネルギーを捕獲し、それを保存・利用するための生物学的分子へ転送する方法を説明せよ。

    • 3.4.B.1 電子伝達系(ETC)反応は、葉緑体、ミトコンドリア、および原核生物の細胞質膜において起こる。光合成において、チラコイド膜を通過する電子は捕獲され、最終的に $\mathrm{NADP^+}$ に受け渡されて還元され、光系IでNADPHとなる。
      • 除外事項: 電子伝達鎖における特定の電子キャリアの完全な名称はAP試験の範囲外である。
      • 除外事項: これらのプロセスに関する経路の具体的な段階、酵素名、中間体については、本コースおよびAP試験の範囲外である。
    • 3.4.B.2 光合成中、クロロフィルは光からのエネルギーを吸収し、光系IおよびII内で電子を高エネルギー準位に励起させる。その後、水が分解され、光系IIから失われた電子を補給するために電子が供給される。
    • 3.4.B.3 光系IおよびIIは、葉緑体のチラコイド膜に埋め込まれており、ETCを介した電子の移動によって接続されている。
    • 3.4.B.4 ETCを通過する際に、酸化還元反応の一連の中で分子間で電子が移動すると、チラコイド膜を挟んでプロトン(水素イオン)の電気化学的勾配が形成される。この膜は、チラコイド膜の外側の低プロトン濃度領域と、チラコイド膜の内側の高プロトン濃度領域を分離している。
    • 3.4.B.5 プロトン勾配の形成は、ATP合成酵素を介してADPおよび無機リン酸からATPが合成されることと連結されている。化学浸透によって膜結合型ATP合成酵素を介してプロトンが流れ戻り、ADPおよび無機リン酸からATPが生成される。これを光燻化と呼ぶ。
    • 3.4.B.6 光反応で捕獲されATPおよびNADPHへ転送されたエネルギーは、カルビン回路における炭酸ガスからの炭水化物産生を駆動する。これは葉緑体のストロマで起こる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    葉緑体は植物の葉肉細胞に充満している——光合成の細胞小器官である
    葉緑体は植物の葉肉細胞に充満している——光合成の細胞小器官である

    光合成は、$\text{CO}_2$と水から糖を合成するために光エネルギーを捕獲し、$\text{O}_2$を放出する。このプロセスには2つの段階がある:

    光合成の2つの段階はATPおよびNADPHによって連結されている
    光合成の2つの段階はATPおよびNADPHによって連結されている
    • 光反応(チラコイド膜内)は光を利用してATPとNADPHを生成し、水を分解して酸素を放出する。
    • カルビン回路(ストロマ内)は、そのATPとNADPHを用いて$\text{CO}_2$を固定し、糖を生成する。

    つまり、光エネルギーはブドウ糖に蓄えられた化学エネルギーへと変換される。

    大気中の酸素の起源

    光合成は最初の生物を養うだけでなく、地球環境を変えた。科学的証拠により、原核生物—特にシアノバクテリア—による光合成が、地球の酸化大気を形成した酸素を生み出したことが裏付けられている。

    その証拠は物理的なものであり、約2.4億年前の岩石に見られる層状鉄鉱物は、海に溶解していた鉄が酸化されて沈殿したことを記録しており、これは遊離酸素を必要とする。この大酸化事件と呼ばれる出来事以前、大気にはほとんど含まれていなかった。

    このことは授業の残りの部分にとって重要な意味を持つ。遊離酸素は好気呼吸を可能にし、これは嫌気経路よりもブドウ糖あたりはるかに多くのATPを放出する。また、それまで存在していた多くの嫌気性生命にとって致命的であったため、これは地球史上最大の絶滅事件の一つであり、生物が自身の環境を変化させた初期の事例でもある。

    3.5

    細胞呼吸

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 3.5.A: 生物が生物学的マクロ分子に蓄えられたエネルギーを利用できるようにするミトコンドリアのプロセスおよび構造的特徴を記述せよ。

    • 3.5.A.1 細胞呼吸は、生物学的マクロ分子由来のエネルギーを用いてATPを合成する。呼吸および発酵は、すべての生命形式に共通する特性である。
    • 3.5.A.2 真核生物の好気性細胞呼吸は、生物学的マクロ分子からのエネルギーを捕獲する一連の酵素触媒反応を伴う。
    • 3.5.A.3 ETCは、酸化還元反応の一連を通じて電子を移動させ、膜を挟んで電気化学的勾配を形成する。
      • i. 細胞呼吸において、NADHおよび $\mathrm{FADH_2}$ が運搬する電子は、最終電子受容体である酸素に向かって移動する一連の電子受容体に受け渡される。好気性原核生物は酸素を最終電子受容体として用い、嫌気性原核生物は他の分子を用いる。
      • ii. 電子の移動(ETCを介して)は、膜の外側の高プロトン濃度領域と膜の内側の低プロトン濃度領域を分離する膜を挟んでプロトン勾配が形成されることに伴う。内膜の折り曲げは表面積を増加させ、より多くのATPを合成することを可能にする。原核生物では、電子の通過に伴ってプロトンが細胞質膜を越えて移動する。
      • iii. 化学浸透によって膜結合型ATP合成酵素を介してプロトンが流れ戻り、ADPおよび無機リン酸からATPが生成される。これを好気性細胞呼吸における酸化燻化と呼ぶ。
      • iv. 好気性細胞呼吸において、酸化燫化と電子伝達を解離させると熱が発生する。この熱は温血動物が体温を調節するために使用されることがある。
      • 除外事項: 電子伝達鎖における特定の電子キャリアの完全な名称はAP試験の範囲外である。
      • 除外事項: これらのプロセスに関する経路の具体的な段階、酵素名、中間体については、本コースおよびAP試験の範囲外である。

    学習目標 3.5.B: 細胞が細胞機能を駆動するために生物学的マクロ分子からエネルギーを得る方法を説明せよ。

    • 3.5.B.1 グリコlysysis(糖解)は、グルコース分子中のエネルギーを放出してATP(ADPおよび無機リン酸から)、NADH($\mathrm{NAD^+}$ から)、およびピルビン酸を生成する生化学的経路である。
    • 3.5.B.2 ピルビン酸は細胞質からミトコンドリアへ輸送され、そこで酸化が行われる。このプロセスではクレブス(クエン酸)回路中に電子が放出され、$\mathrm{NAD^+}$がNADHに、FADが$\mathrm{FADH_2}$に還元され、$\mathrm{CO_2}$が放出される。
    • 3.5.B.3 クレブス回路はミトコンドリア基质で起こる。クレブス回路中、有機中間体から二酸化炭素が放出され、ADPと無機リン酸からATPが合成され、共酵素である$\mathrm{NAD^+}$およびFADによって電子が移動する。
    • 3.5.B.4 糖解系およびクレブス回路の反応で抽出された電子は、NADHおよび$\mathrm{FADH_2}$によってミトコンドリア内膜上のETCへ伝達される。
    • 3.5.B.5 電子がETCを通過しながら一連の反応内で分子間で移動すると、ミトコンドリア内膜を挟んでプロトン(水素イオン)の電気化学勾配が形成される。ミトコンドリア基质内のpHは、膜間空間よりも高い。
    • 3.5.B.6 発酵は酸素がない状態でも糖解系を進行させ、アルコールや乳酸のような有機分子を生産する。
      • 除外事項: 糖解系およびクレブス回路の各段階、関連する分子の構造、および関与する酵素の名前の暗記は、本コースおよびAP試験の対象外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    ミトコンドリアのTEM写真:折れ曲がった内膜(クリステ)が呼吸のための表面積を増加させている
    ミトコンドリアのTEM写真:折れ曲がった内膜(クリステ)が呼吸のための表面積を増加させている

    細胞呼吸はブドウ糖に含まれるエネルギーを放出してATPを生成し、主に酸素を使用する。その段階は以下の通り:

    好気呼吸の各段階と、それらが細胞内で起こる場所
    好気呼吸の各段階と、それらが細胞内で起こる場所
    • グリコールシス(細胞質内)はブドウ糖を分解し、少量のATPを生成する。
    • クレブス回路(ミトコンドリアマトリックス内)は$\text{CO}_2$を放出し、電子キャリアーに電荷を載せる。
    • 電子伝達系(内膜内)はこれらの電子を用いてプロトンを汲み出し、大部分のATPを生成し、最終的な電子受容体として酸素を用いる。

    酸素がない場合、細胞はグリコールシスを維持するために発酵を用い、はるかに少ないATPしか生成しない。光合成と呼吸は補完関係にある—oneの産物が他方の基質となる。

    ** worked example.** 好気呼吸において1分子のブドウ糖からは、グリコールシスで約2 ATP、クレブス回路で2 ATP、酸化燐酸化で約28 ATPが得られ、合計で$\approx$32 ATPとなる。酸素がない場合、グリコールシスだけが機能するため、発酵ではブドウ糖あたり2 ATPしか得られず—約16分のエネルギー—which is why aerobic pathways dominate in oxygen-rich cells.(※原文の英語部分の意訳:これは好気経路が酸素豊富な細胞で支配的である理由である。)

    3.5

    試験対策

    • 酵素は活性化エネルギーを下げることで働き、消費されません;その活性部位は特定の基質に対してのみ特異的である(鍵と穴の一致)。
    • 速度は温度の上昇に伴って増加しますが、最適温度に達するとそれ以上上昇せず、酵素は変性して速度は低下します(通常の反応とは異なります)。
    • ATP↔ADPサイクルを理解しておく:リン酸結合の切断によってエネルギーが放出され、細胞の活動を支える。
    • 全体方程式を書く:光合成はエネルギーを蓄える(ブドウ糖を合成)、呼吸はそれを放出する(ブドウ糖を分解)—これらは互いに逆のプロセスである。
    • 各段階に対応する場所と、酸素を必要とするかどうかをマッチングさせる。
  • 4

    細胞間通信と細胞周期

    レッスンを視聴
    4.1

    Cell Communication

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 4.1.A: 細胞同士が相互に通信する方法を説明せよ。

    • 4.1.A.1 細胞は、他の細胞との直接接触或通过化学シグナルによる遠隔通信によって相互に信号を送る。
      • 4.1.A.1 の例示:
        • 免疫細胞は細胞間接触により相互作用し、抗原提示細胞(APCs)、ヘルパーT細胞、キラーT細胞が含まれる。

    学習目標 4.1.B: 細胞が短距離および長距離で相互に通信する方法を説明せよ。

    • 4.1.B.1 細胞は、シグナルを発信する細胞の周辺にある標的細胞に作用する局所調節因子を用いて短距離通信を行う。
      • 4.1.B.1 の例示:
        • 神経伝達物質
        • 植物の免疫応答
        • バクテリアのクオラムセンシング
        • 胚発生におけるモルフォゲン
    • 4.1.B.2 ある種類の細胞から放出されたシグナルは、異なる種類の標的細胞まで長距離を移動する。
      • 4.1.B.2 の例示:
        • インスリン
        • ヒト成長ホルモン
        • 甲状腺ホルモン
        • テストステロン
        • エストロゲン

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Cells coordinate by sending and receiving chemical signals 信号. A signaling cell releases a ligand 配体 that binds a receptor 受体 on a target cell. Signals travel over different ranges: direct contact (cell junctions), local signaling (nearby cells, like neurotransmitters), and long-distance signaling (hormones 激素 through the blood).

    A signal molecule (ligand) binds a matching receptor on the target cell
    A signal molecule (ligand) binds a matching receptor on the target cell
    English 日本語
    signals/ˈsɪɡnlz/ 信号
    ligand/ˈlɪɡænd/ 配位子
    receptor/rɪˈseptə/ レセプター
    hormones/ˈhɔːməʊnz/ ホルモン
    4.2

    Introduction to Signal Transduction

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 4.2.A: シグナル伝達経路の構成要素を説明せよ。

    • 4.2.A.1 シグナル伝達経路は、シグナル受容と細胞応答を結びつける。
    • 4.2.A.2 多くのシグナル伝達経路にはタンパク質修飾が含まれ、リン酸化カスケードに関与する。

    学習目標 4.2.B: シグナル伝達経路の構成要素が細胞応答を生み出す役割を説明せよ。

    • 4.2.B.1 シグナル伝達は、標的細胞内の受容体タンパク質によって化学メッセンジャー(リガンド)が認識されることから始まる。
      • i. 受容体のリガンド結合ドメインは特定の化学メッセンジャーを認識し、これはペプチド(タンパク質)または小分子であることがある。
      • ii. Gタンパク質結合性受容体は真核生物における受容体タンパク質の一例である。
      • iii. 受容体は、標的細胞の表面、または細胞質や核内に位置することがある。
    • 4.2.B.2 シグナルカスケードは受容体から細胞標的へシグナルを伝達し、流入したシグナルを増幅して、適切な細胞応答をもたらす。応答には、細胞増殖、分子の分泌、あるいは遺伝子発現が含まれる。
      • i. リガンドが結合した後、受容体タンパク質の細胞内ドメインの形状が変化し、シグナルの伝達が開始される。
      • ii. 酵素および第二 metavar(cAMPなどの環状AMP)は、細胞内シグナルを伝達・増幅する。
      • iii. ホルモンは、血流中を長距離を移動できるシグナルメッセンジャーの一例である。
      • iv. リガンドの結合により、リガンド依存性チャネルが開くか閉じたりする。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Signal transduction 信号转导 converts an outside signal into a cellular response in three stages: reception (ligand binds receptor), transduction (a relay of molecules inside the cell), and response (a change in the cell's activity, such as switching on a gene). Receptors are specific, so a cell only responds to signals it can receive.

    A chemical synapse: signal transduction passes a message across a gap with a ligand and receptor
    A chemical synapse: signal transduction passes a message across a gap with a ligand and receptor
    English 日本語
    Signal transduction/ˈsɪɡnl trænsˈdʌkʃn/ シグナル転送
    4.3

    Signal Transduction Pathways

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 4.3.A: シグナル伝達経路によって引き起こされる異なる種類の細胞応答を説明せよ。

    • 4.3.A.1 シグナル伝達は、遺伝子発現や細胞機能の変化をもたらすことがあり、これにより表現型が変化したり、 programmed cell death(アポトーシス)が起こったりする。
      • 4.3.A.1 の例示:
        • 微生物が化学メッセンジャーを用いて近隣の他の細胞と通信し、集団密度に応じた特定の経路を調節する(クオラムセンシング)。
        • 哺乳類におけるグリコゲン分解に対するエピネフリン刺激。

    学習目標 4.3.B: どの signaling molecule の構造の変化が、signaling pathway の活性に影響を与えるかを説明せよ。

    • 4.3.B.1 シグナル伝達経路の変化は細胞応答を変化させることができる。受容体タンパク質のどのドメイン、あるいはシグナル伝達経路のどの構成要素にも生じる突然変異は、後続のシグナル伝達を変化させることで、下流の構成要素に影響を与える可能性がある。
      • 4.3.B.1 の例示:
        • サイトカインは遺伝子発現を調節し、細胞の複製および分裂を可能にする。
        • 酵母の交尾フェロモンは、交尾関連遺伝子の発現を引き起こす。
        • エチレン濃度の変化は、異なる酵素の生産量を変化させ、果実の成熟を促す。
        • HOX遺伝子は、胚発生中に動物の体計画を調節する。
    • 4.3.B.2 シグナル伝達経路のいずれかの構成要素と相互作用する化学物質は、その経路を活性化または阻害することがある。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    In the transduction stage, the signal passes through a pathway – often a cascade of proteins that activate one another, frequently amplifying the signal so a few ligands trigger a large response. Second messengers (like cyclic AMP or calcium ions) spread the signal quickly through the cell. A change in one step can alter the whole outcome.

    A signalling cascade amplifies the message inside the cell
    A signalling cascade amplifies the message inside the cell
    4.4

    Feedback

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 4.4.A: 正のフィードバックおよび負のフィードバックがホメオスタシス(恒常性)の維持にどのように寄与するかを説明せよ。

    • 4.4.A.1 生物体は、内部・外部の変化に対応して体内環境を維持するために、フィードバック機構を用いる。
      • i. 負のフィードバック機構は、生理学的プロセスを調節するために初期刺激を低減することにより、ホメオスタシスを維持する。あるシステムが攪乱された場合、負のフィードバック機構はそのシステムを目標設定値に戻す。これらのプロセスは、分子レベル、細胞レベル、個体レベルで機能する。
        • 4.4.A.1.i に関する例:
          • インスリン/グルカゴンによる血糖値の調節
      • ii. 正のフィードバック機構は、生物体内的の反応やプロセスを増幅させる。反応を引き起こす変数は、初期設定値からさらに遠ざかる。刺激がさらに強化されることで増幅が起こり、それに応じて追加の反応が生じ、システムの変化がもたらされる。
        • 4.4.A.1.ii に関する例:
          • 哺乳類の授乳
          • 分娩時の陣痛の始動
          • 果実の熟成

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Feedback 反馈 keeps systems balanced:

    Negative feedback detects and corrects a change
    Negative feedback detects and corrects a change
    • Negative feedback 负反馈 counteracts a change to restore a set point (like a thermostat) – it maintains homeostasis 稳态.
    • Positive feedback 正反馈 amplifies a change to push a process to completion (like childbirth contractions or blood clotting).
    探索

    負のフィードバックは安定性を保つ

    負のフィードバックは変化を検知してそれを逆転させ、変数(血中ブドウ糖など)を一定点付近に維持する。外に押し出すとシステムが修正される様子を見る。

    English 日本語
    Feedback/ˈfiːdbæk/ フィードバック
    Negative feedback/ˈneɡətɪv ˈfiːdbæk/ ネガティブフィードバック
    homeostasis/ˌhəʊmiːəˈstɑːsiz/ ホメオスタシー
    Positive feedback/ˈpɒzɪtɪv ˈfiːdbæk/ 正のフィードバック
    4.5

    Cell Cycle

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 4.5.A: 細胞周期で起こる一連の出来事を説明せよ。

    • 4.5.A.1 細胞周期とは、真核細胞の増殖と生殖を制御する、厳密に調節された一連の出来事である。
      • i. 細胞周期は、間期(G1, S, G2)、有糸分裂、胞質分裂という連続した段階からなる。
      • ii. G1相:細胞は代謝的に活発であり、小器官および細胞質成分を複製している。
      • iii. S相:DNAはクロマチンの形をとっており、相同な2本の姉妹染色分体が一次着丝点で連結されるように複製される。
      • iv. G2相:タンパク質合成が行われ、大量のATPが産生され、中心小体が増殖する。
      • v. 細胞は分裂を停止する段階(G0)に入ることがあるが、適切なシグナルに応答して細胞周期に再び入ることができる。
      • vi. 分裂しない細胞は、細胞周期から外れるか、あるいは特定の段階で停滞することがある。

    学習目標 4.5.B: 有糸分裂が染色体を親世代の細胞から娘世代の細胞へ如何に継承するかを説明せよ。

    • 4.5.B.1 有糸分裂は、真核生物において、親細胞から遺伝的に同一な2つの娘細胞への完全なゲノムの移行を保証するプロセスである。
      • i. 有糸分裂は、成長、組織修復、無性生殖に関与する。
      • ii. 有糸分裂は、前中期、中期、後期、末期という連続したステップで行われ、細胞周期内で間期と交互に現れる。
      • iii. 前中期:姉妹染色分体が凝縮し、有糸分裂紡錘体の形成が始まり、中心小体が細胞の反対極へ移動する。
      • iv. 中期:紡錘糸が赤道板上で染色体を配列させる。
      • v. 後期:姉妹染色分体のペアが分離し、紡錘糸が染色分体を極へ引っ張る。
      • vi. 末期:有糸分裂紡錘体が分解し、新しい核膜が形成され、その後胞質分裂が行われる。
      • vii. 胞質分裂:動物細胞では分裂溝が形成され、植物細胞では細胞板が形成され、2つの新たな娘細胞が生まれる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Onion root-tip cells at different stages of mitosis (light micrograph)
    Onion root-tip cells at different stages of mitosis (light micrograph)

    The cell cycle 细胞周期 is the life of a cell from one division to the next: interphase 间期 (G1 growth, S DNA replication, G2 preparation) followed by mitosis 有丝分裂 (M) and cytokinesis, which produce two identical daughter cells. Interphase takes most of the time; DNA is copied only in S phase.

    The cell cycle: interphase, then mitosis and cytokinesis
    The cell cycle: interphase, then mitosis and cytokinesis
    A fibroblast dividing: cytokinesis splits one cell into two after mitosis finishes
    A fibroblast dividing: cytokinesis splits one cell into two after mitosis finishes
    Onion root tip at metaphase: chromosomes line up before sister chromatids separate
    Onion root tip at metaphase: chromosomes line up before sister chromatids separate
    探索

    細胞周期を段階ごとに進む

    細胞周期はDNAを複製(S期)し、その後有糸分裂で均等に分割して2つの同一細胞を生じる。段階を進める。

    English 日本語
    cell cycle/sel ˈsaɪkl/ 細胞周期
    interphase/ˌɪntəˈfeɪz/ 間期
    mitosis/maɪˈtəʊsɪs/ 有糸分裂
    4.6

    Regulation of Cell Cycle

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 4.6.A: チェックポイントが細胞周期の調節に果たす役割を説明せよ。

    • 4.6.A.1 細胞周期の進行を調節するための多数の内部コントロール、すなわちチェックポイントが存在する。
    • 4.6.A.2 シクリンとシクリン依存性キナーゼとの相互作用が細胞周期を制御する。
      • 除外事項: 特定のシクリン-CdKペアや成長因子に関する知識はAP試験の範囲外である。

    学習目標 4.6.B: 細胞周期への撹乱が細胞や生物体に与える影響を説明せよ。

    • 4.6.B.1 細胞周期への撹乱は、がんやアポトーシス(プログラム細胞死)の原因となることがある。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    The cycle is controlled at checkpoints 检查点 that verify conditions before proceeding (Is the DNA intact? Are chromosomes attached?). Internal signals (cyclins and their kinases) and external signals drive the cycle forward. When this control fails – for example, a mutation that ignores a checkpoint – cells divide uncontrollably, which underlies cancer 癌症.

    Uncontrolled division from failed checkpoints forms a tumour
    Uncontrolled division from failed checkpoints forms a tumour

    Worked example. Signal amplification in a cascade: one hormone activates one receptor, which switches on about 100 relay proteins, and each of those makes about 1,000 second-messenger molecules — so a single signal produces roughly $100 \times 1000 = 10^{5}$ product molecules. This is why a hormone concentration as low as $10^{-9}\,\text{M}$ can trigger a large cellular response.

    English 日本語
    checkpoints/ˈtʃekpɔɪnts/ チェックポイント
    cancer/ˈkænsə/ 癌
    4.6

    Exam tips

    • In signal transduction name the three stages: reception → transduction → response.
    • Negative feedback reverses a change to keep conditions steady (homeostasis); positive feedback amplifies a change to completion (childbirth, clotting).
    • Order the cell cycle: interphase (grow, copy DNA in S phase) then mitosis → two identical daughter cells.
    • The DNA is copied once, in S phase, so each daughter gets a full copy.
    • Failed checkpoints allow uncontrolled division → cancer.
  • 5

    遺伝

    レッスンを視聴
    5.1

    Meiosis

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 5.1.A: 減数分裂が染色体を親世代から子世代へ如何に継承するかを説明せよ。

    • 5.1.A.1 減数分裂は、有性生殖を行う二倍体生物において、単倍体の配偶子細胞(娘細胞とも呼ばれる sometimes referred to as daughter cells)の形成を保証するプロセスである。
    • 5.1.A.2 減数分裂Iには以下のステップが含まれる:
      • i. 前中期I:相同染色体が対をなし凝縮し、結合(シナプシス)が起こり、 subsequently chiasmata(キアズマ)が形成される。減数分裂紡錘体の形成が始まり、中心小体が細胞の反対極へ移動し、核膜が崩壊する。
      • ii. 中期I:減数分裂紡錘糸が、中期板上で相同染色体のペアを赤道板上に配列させる。
      • iii. 後期I:減数分裂紡錘糸が染色体を極へ引っ張るため、相同染色体は分離するが、姉妹染色分体は依然として連結したままとなる。
      • iv. 末期I:減数分裂紡錘体が分解し、新しい核膜が形成され、分裂溝(動物細胞)または細胞板(植物細胞)が形成され、胞質分裂が行われる。2つの単倍体の娘細胞が形成される(減数分裂Iの終了時)。
    • 5.1.A.3 減数分裂IIには以下のステップが含まれる:
      • i. 前中期II:減数分裂紡錘体が形成され、一次着丝点で連結された姉妹染色分体が減数分裂紡錘体に付着する。
      • ii. 後期II: 染色体が後期板に沿って配列し、各分染色体の動点体は極から伸びる紡錘小管に結合している。
      • iii. 後期II: 着丝点のタンパク質が分解され、姉妹分染色体が引き離されて細胞内の反対側の極へ向かって移動する。
      • iv. 末期II: 減数分裂用紡錘体が崩壊し、新しい核膜が発達し、分裂溝(動物細胞)または細胞板(植物細胞)が形成され、分染色体の凝縮が解除され始め、細胞質分裂が起こる。未複製分染色体を含む4個の単倍体娘細胞が生成される。

    学習目標 5.1.B: 有糸分裂と減数分裂の各相と結果の類似点および相違点を説明する。

    • 5.1.B.1 有糸分裂と減数分裂は、紡錘装置を用いて染色体を移動させる点で類似しているが、生成される細胞の数や娘細胞の遺伝的内容では異なる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    A human karyotype: 22 pairs of autosomes plus the sex chromosomes
    A human karyotype: 22 pairs of autosomes plus the sex chromosomes

    Meiosis 减数分裂 makes gametes 配子 (eggs and sperm) with half the chromosome number, so fertilization restores the full set. One diploid cell divides twice to give four haploid cells. Meiosis I separates homologous chromosomes 同源染色体 (reducing the number); meiosis II separates sister chromatids (like mitosis).

    Meiosis halves the chromosome number in two divisions
    Meiosis halves the chromosome number in two divisions
    探索

    細胞の染色体を分割する

    減数分裂は染色体数を半分にし、遺伝子をシャッフルして4つの遺伝的に多様な配偶子を作る。分割を見るために進む。

    English 日本語
    Meiosis/meɪˈəʊsɪs/ 減数分裂
    gametes/ˈɡæmiːts/ 生殖胞(ガメート)
    homologous chromosomes/həˈmɒləɡəs ˈkrəʊməsəʊmz/ 相同染色体
    5.2

    Meiosis and Genetic Diversity

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 5.2.A: 減数分裂のプロセスが遺伝的多様性をどのように生み出すかを説明する。

    • 5.2.A.1 減数分裂Iにおける相同染色体の正確な分離と、減数分裂IIにおける姉妹染色分体の正確な分離により、各生殖細胞は母方由来と父方由来の染色体が混在した単倍体(1n)の染色体セットを受け取る。誤った分離(非分離)が起こると、生殖細胞は単倍体ではなくなる。
    • 5.2.A.2 減数分裂前期I中、非姉妹染色分体は交叉(組換え)と呼ばれるプロセスを通じて遺伝物質を交換し、結果として得られる生殖細胞間の遺伝的多様性が増加する。
    • 5.2.A.3 真核生物の有性生殖は、交叉、減数分裂中の染色体のランダムな配分、およびその後の生殖細胞の受精を含め、遺伝的変異を増加させる。
      • 除外文: 様々な植物や動物の有性生殖サイクルの詳細に関する知識はAP試験の範囲外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Meiosis shuffles genes three ways, so offspring differ from parents and each other:

    Independent assortment produces many gamete combinations
    Independent assortment produces many gamete combinations
    Crossing over swaps segments between homologous chromosomes
    Crossing over swaps segments between homologous chromosomes
    • Crossing over 交叉互换: homologous chromosomes swap segments in meiosis I.
    • Independent assortment 自由组合: each homologous pair lines up and separates randomly.
    • Random fertilization: any sperm can meet any egg.

    Together these create enormous variation – the raw material for evolution.

    English 日本語
    Crossing over/ˈkrɒsɪŋ ˈəʊvə/ 交差(クロッシングオーバー)
    Independent assortment/ˌɪndɪˈpendənt əˈsɔːtmənt/ 独立の配列
    5.3

    Mendelian Genetics

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 5.3.A: メンデルの法則によって記述される遺伝子と形質の継承を説明する。

    • 5.3.A.1 メンデルの分離の法則と独立の法則は、異なる染色体上の遺伝子にも適用できる。
    • 5.3.A.2 ほとんどの場合、受精は2つの単倍体生殖細胞の融合を伴い、二倍体の染色体数を回復させ、合子内で新たな対立遺伝子の組み合わせを作成することで集団の遺伝的多様性を高める。
      • i. 確率の法則を用いて、単一遺伝子形質の親から子への伝わり方を分析することができる。
      • ii. 単交配、複交配、およびテスト交配を用いて、対立遺伝子が優性か劣性かを決定することができる。
      • iii. 生物型の遺伝子型とは、ある個体において1つ以上の遺伝子について受け継いだ対立遺伝子のセットのことである。生物型の遺伝子型は、各遺伝子についてホモ接合体またはヘテロ接合体可以是也可以是。
      • iv. 生物型の表現型とは、受け継いだ形質の観察可能な発現のことである。
      • v. 継承のパターン(常染色体、遺伝子連鎖、性染色体連関)や対立遺伝子が優性か劣性かは、系図表を含むデータからしばしば予測可能である。ポンネット四角表を用いて、親および子の遺伝子型や表現型を予測することができる。
      • 式(確率の法則): $A$ と $B$ が互いに排他的である場合、以下の式が成り立つ: $P(A \text{ or } B) = P(A) + P(B)$
      • 数式(確率の法則): $A$ と $B$ が独立である場合、次式が成り立つ: $P(A \text{ and } B) = P(A) \times P(B)$

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Natural variation in snail shell banding — heritable differences selection can act on
    Natural variation in snail shell banding — heritable differences selection can act on

    A gene's alternative versions are alleles 等位基因. An organism's genotype 基因型 (its alleles) produces its phenotype 表型 (its traits). Mendel's rules: a dominant 显性 allele masks a recessive 隐性 one; the two alleles segregate into different gametes (law of segregation); genes for different traits assort independently. A Punnett square 庞纳特方格 predicts offspring ratios (a heterozygous cross gives 3:1). Homozygous 纯合 means two identical alleles; heterozygous 杂合 means two different.

    A monohybrid Punnett square giving a 3:1 ratio
    A monohybrid Punnett square giving a 3:1 ratio

    Worked example. For a dihybrid cross of two independent genes, $AaBb\times AaBb$, use the multiplication rule instead of a $16$-box square. Each gene alone gives $\tfrac34$ dominant, so the chance an offspring shows both dominant traits is $\tfrac34\times\tfrac34=\tfrac{9}{16}$, and the chance of the fully recessive $aabb$ is $\tfrac14\times\tfrac14=\tfrac{1}{16}$. Multiplying two independent $3{:}1$ ratios is what produces the classic $9{:}3{:}3{:}1$ pattern.

    探索

    2つの親を交配する

    ペンネット正方形は各親のアレルを組み合わせ、子孫の比率を予測する。親の遺伝子型を設定して期待される割合を読む。

    English 日本語
    alleles/əˈliːlz/ アレル
    genotype/ˈdʒenətaɪp/ 遺伝子型
    phenotype/ˈfenətaɪp/ 表現型
    dominant/ˈdɒmɪnənt/ 優位な
    recessive/rɪˈsesɪv/ 劣性
    Punnett square/ˈpʌnɪt skweə/ ペンネット表
    Homozygous/ˌhɒməˈzɪɡəs/ ホモ接合
    heterozygous/ˌhetrəˈzɪɡəs/ 複合体
    5.4

    Non-Mendelian Genetics

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 5.4.A: メンデルによる形質継承モデルからの逸脱を説明する。

    • 5.4.A.1 多くの形質の継承パターンはメンデルの法則が予測する比率に従わず、観察された表現型の比率が予測される比率と統計的に異なる場合に定量的分析によって識別できる。
      • i. 同じ染色体上にある遺伝子は遺伝子連鎖にあると言われる。これらの連鎖遺伝子が減数分裂中に一緒に分離する確率を用いて、染色体上でのそれらの間のマップ距離(またはマップ単位)を計算できる。この計算は遺伝子マッピングまたは遺伝学的マッピングと呼ばれる。
      • ii. 共優性とは、両方の対立遺伝子由来の表現型が同時に発現し、ヘテロ接合体がどちらのホモ接合体とも異なる表現型を示す現象である。
      • iii. 不完全優性とは、ある遺伝子の対立遺伝子のどちらも他方を覆い隠せず、ヘテロ接合体の表現型が優性と劣性の表現型の中間的な混合版となる現象である。
    • 5.4.A.2 性染色体連関形質(X-またはY-連関)と呼ばれる一部の形質は、性染色体上の遺伝子によって決定される。性染色体連関形質の継承パターンは、系図表を含むデータからしばしば予測可能であり、親および子の遺伝子型と表現型を示す。
      • EK 5.4.A.2 のための例示:
        • 性染色体連関形質(X-またはY-連関)は性染色体上に位置する。
        • 性染色体連関形質(X-またはY-連関)は、XX個体よりもXY個体の方で高い頻度で継承される。
        • 特定の種では、性決定の染色体基盤がXとY染色体に基づくものではない(例:鳥類のZW、ミツバチのハプロジプロイディ)。
    • 5.4.A.3 多効果とは、単一の遺伝子の発現が複数の形質や効果をもたらす現象であり、これらの形質はしたがって独立に分離しない。
    • 5.4.A.4 一部の形質は非核遺伝によって生じる。
      • i. クロロプラストとミトコンドリアは生殖細胞および娘細胞にランダムに分配されるため、クロロプラストDNAおよびミトコンドリアDNAによって決定される形質は単純なメンデル的法則に従わない。
      • ii. 動物では、ミトコンドリアは通常卵によって遺伝され、精子ではなく遺伝されるため、ミトコンドリアDNAによって決定される形質は一般的に母性遺伝を示す。
      • iii. 植物では、ミトコンドリアと葉緑体は花粉ではなく胚珠によって遺伝されるため、ミトコンドリアや葉緑体によって決定される形質は一般的に母性遺伝を示す。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Many traits do not follow simple dominance:

    Sex linkage gives different results for sons and daughters
    Sex linkage gives different results for sons and daughters
    • Incomplete dominance 不完全显性: heterozygotes are a blend (red × white → pink).
    • Codominance 共显性: both alleles show fully (AB blood type).
    • Multiple alleles, polygenic 多基因 traits (many genes, like height), pleiotropy (one gene, many effects), and sex-linked 伴性 genes (on the X chromosome) all give more complex ratios.

    Worked example (chi-square test). To check whether real data fit a predicted ratio, use $\chi^2=\sum\dfrac{(o-e)^2}{e}$. A monohybrid cross predicts $3{:}1$, so of $80$ offspring you expect $60$ dominant and $20$ recessive, but you observe $55$ and $25$. Then $\chi^2=\dfrac{(55-60)^2}{60}+\dfrac{(25-20)^2}{20}=\dfrac{25}{60}+\dfrac{25}{20}=0.42+1.25=1.67$. With $1$ degree of freedom the critical value at $p=0.05$ is $3.84$; since $1.67<3.84$, we fail to reject the null hypothesis – the deviation is within chance.

    English 日本語
    Incomplete dominance/ɪŋkəmˈpliːt ˈdɒmɪnəns/ 不完全優性
    Codominance/ˈkəʊdəmɪnəns/ 共優性
    polygenic/ˌpɒlɪˈdʒenɪk/ 多因子形質
    sex-linked/seks lɪŋkt/ 性染色体連座
    5.5

    Environmental Effects on Phenotype

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 4 — システムの相互作用): 生物システムは互いに相互作用し、これらのシステムおよびその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 5.5.A: 異なる環境条件下において、同じゲノタイプが複数の表現型をもたらす理由を説明する。

    • 5.5.A.1 環境条件は遺伝子発現に影響を与え、表現型可塑性(個々のゲノタイプが異なる表現型を生み出す能力など)を引き起こすことがある。
      • EK 5.5.A.1 の例示:
        • 人間の身長と体重
        • 土壌pHに基づく花の色
        • 極域動物の季節による毛色の変化
        • 爬虫類の性決定
        • UV照射の増加が動物のメラニン産生に与える影響
        • 酵母および他の真菌におけるフェロモン産生に対する相反する交尾型の存在

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Phenotype is not set by genes alone – the environment also matters. Temperature, nutrition, and other factors can change how genes are expressed (a Himalayan rabbit's dark fur where it is cold, a plant's height with more sunlight). So identical genotypes can give different phenotypes in different conditions.

    5.5

    Exam tips

    • Contrast mitosis (2 identical, full chromosome number) with meiosis (4 non-identical gametes, half the number).
    • Explain variation from crossing over, independent assortment, and random fertilisation.
    • Use the multiplication rule for dihybrid crosses (each gene's $3{:}1$ multiplied), and a chi-square test ($\chi^2=\sum\frac{(o-e)^2}{e}$) to judge observed vs expected ratios.
    • Keep genotype (the alleles) separate from phenotype (what you see) — $AA$ and $Aa$ can look the same.
    • Recognise non-Mendelian patterns: incomplete dominance, codominance, and sex linkage.
  • 6

    遺伝子発現と調節

    レッスンを視聴
    6.1

    DNAとRNAの構造

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.1.A: 親世代から次世代へ遺伝情報を伝える際に関与する構造を記述する。

    • 6.1.A.1 遺伝情報はDNA分子に蓄積され、後世代へ受け継がれる。また、場合によってはRNA分子によっても行われる。
      • 6.1.A.1.i 原核生物は通常、環状染色体を持つ。
      • 6.1.A.1.ii 真核生物は通常、複数の直線状染色体を持ち、これらはDNAで構成されている。これらの染色体はヒストンおよび関連タンパク質によって凝縮される。
    • 6.1.A.2 原核生物と真核生物は、染色体外の環状DNA分子であるプラシドを含むことができる。

    学習目標 6.1.B: 遺伝物質としてDNAが使われることを可能にするDNAの特性を記述する。

    • 6.1.B.1 核酸は、進化を通じて保存された特定のヌクレオチド塩基対形成を示す。
      • 6.1.B.1.i プリン(グアニンおよびアデニン)は二重環構造を持つ。
      • 6.1.B.1.ii ピリミジン(シトシン、チミン、ウラシル)は単一環構造を持つ。
      • 6.1.B.1.iii プリンはピリミジンと対をなす:アデニンはチミン(またはRNAではウラシル)と、グアニンはシトシンと対をなす。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    細胞抽出液からの沈殿DNAの巻き取り — DNAは実際に可視化できる分子である
    細胞抽出液からの沈殿DNAの巻き取り — DNAは実際に可視化できる分子である

    DNA は二本鎖の二重らせんとして遺伝情報を持ちます。ヌクレオチドは特定のルールでペアリングし、AはTと、GはCと対応します(相補的塩基対合)。これにより一本の鎖がもう一本の鎖を決定します。両方の鎖は反平行に走ります。RNA は一本鎖であり、チミンの代わりにウラシル(U)を使用し、リボース糖を含みます。

    相補的塩基対によって保持された二本の反平行なDNA鎖
    相補的塩基対によって保持された二本の反平行なDNA鎖

    DNAのパッケージング方法はドメインによって異なり、CEDでは両方を問うている。

    • 原核生物は通常、細胞質内に単一の環状染色体を持ち、追加の小さな輪(プラスミド)を持つことが多い。
    • 真核生物は通常、複数の直線状染色体を持ち、それぞれがヒストンと呼ばれるタンパク質に巻き取られることで凝縮されている。この詰まり方が、数マイクロメートルの核内に2メートルものDNAを収めることを可能にしている——また、巻きの密な領域は転写装置がアクセスしにくいため、パッケージング自体が遺伝子発現調節の一レベルとなっている。
    6.2

    DNA複製

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.2.A: 世代間の伝達のために遺伝情報がコピーされるメカニズムを記述する。

    • 6.2.A.1 DNA複製は、遺伝情報の連続性を保証する。
      • 6.2.A.1.i DNAは5'から3'方向に合成される。
      • 6.2.A.1.ii 複製は半保存的プロセスであり、DNAの一本鎖が新しい相補的なDNA鎖のためのテンプレートとなることを意味する。
      • 6.2.A.1.iii ヘリカーゼがDNA鎖を解く。
      • 6.2.A.1.iv トポイソメラーゼが複製フォークの前にある超らせん構造を緩める。
      • 6.2.A.1.v DNAポリメラーゼは、DNA合成を開始するためにRNAプライマーを必要とする。
      • 6.2.A.1.vi DNAポリメラーゼは、リードストランド上では新しいDNA鎖を連続的に、ラグgingストランド上では不連続的に合成する。
      • 6.2.A.1.vii リガーゼはラグgingストランド上の断片をつなぐ。
      • 除外事項: ステップの名前およびDNAポリメラーゼ、リガーゼ、RNAポリメラーゼ、ヘリカーゼ、トポイソメラーゼ以外の特定の酵素に関する名称は、AP試験の対象外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    細胞分裂の前に、DNAは半保存的にコピーされます。らせんが解け、古い各鎖が新しい鎖の鋳型となり、娘らせんはそれぞれ1本の古い鎖と1本の新しい鎖を持ちます。DNAポリメラーゼは塩基対合ルールに従ってヌクレオチドを追加し、新しい鎖を合成しながら校对(校正)を行います。

    複製フォークにおける半保存的DNA複製
    複製フォークにおける半保存的DNA複製
    6.3

    転写とRNA処理

    シラバス
    Big IdeaLearning ObjectiveEssential Knowledge

    Big Idea 3 — Information Storage and Transmission
    Living systems store, retrieve, transmit, and respond to information essential to life processes.

    6.3.A
    Describe the mechanisms by which genetic information flows from DNA to RNA to protein.

    • 6.3.A.1 The sequence of the RNA bases, together with the structure of the RNA molecule, determines RNA function.
      • 6.3.A.1.i Messenger RNA (mRNA) molecules carry information from DNA in the nucleus to the ribosome in the cytoplasm.
      • 6.3.A.1.ii Distinct transfer RNA (tRNA) molecules bind specific amino acids and have anticodon sequences that base pair with the codons of mRNA. tRNA is recruited to the ribosome during translation to generate the primary peptide sequence based on the mRNA sequence.
      • 6.3.A.1.iii Ribosomal RNA (rRNA) molecules are functional building blocks of ribosomes.
    • 6.3.A.2 RNA polymerases use a single template strand of DNA to direct the inclusion of bases in the newly formed RNA molecule. This process is known as transcription.
    • 6.3.A.3 The enzyme RNA polymerase synthesizes mRNA molecules in the 5' to 3' direction by reading the template DNA strand in the 3' to 5' direction.
    • 6.3.A.4 In eukaryotic cells the mRNA transcript undergoes a series of enzyme-mediated modifications.
      • 6.3.A.4.i The addition of a poly-A tail makes mRNA more stable.
      • 6.3.A.4.ii The addition of a GTP cap helps with ribosomal recognition.
      • 6.3.A.4.iii The excision of introns, along with the splicing and retention of exons, generates different versions of the resulting mature mRNA molecule. This process is known as alternative splicing.

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    転写では、遺伝子のDNAがmRNA(メッセンジャーRNA)にコピーされます。RNAポリメラーゼが鋳型鎖を読み取り、相補的なRNAを合成します。真核生物では、その後mRNAは処理され、キャップとテールが追加され、イントロン(非コード領域)がスプライシングされて除去され、エクソンが残ります。

    イントロンが除去され、エクソンが連結されて成熟したmRNAとなる
    イントロンが除去され、エクソンが連結されて成熟したmRNAとなる

    処理中に追加される5′キャップは、修飾されたグアニンヌクレオチド——GTPキャップ——であり、その機能は認識です。これはリボソームがmRNAを認識して結合するのを助け、同時に転写物が核から出る際に分解されるのを保護します。

    探索

    DNAをmRNAに転写する

    転写ではDNAテンプレートをmRNAにコピーし、A→U、T→A、C→G、G→Cと対合する。進んでRNA鎖を塩基ごとに構築する。

    6.4

    翻訳

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.4.A: 生物体の表現型がゲノタイプによってどのように決定されるかを説明する。

    • 6.4.A.1 mRNAの翻訳によるポリピプチド生成は、原核生物および真核生物の両方の細胞質、ならびに真核生物の粗面小胞体細胞質表面にあるリボソーム上で行われる。
    • 6.4.A.2 原核生物において、mRNA分子の翻訳はその転写中に行われる。
    • 6.4.A.3翻訳は、開始、伸長、終結を含む多くの連続したステップを伴います。翻訳の主な特徴は以下の通りです:
      • 6.4.A.3.i リボソーム内のrRNAが起始コドン(AUG、アミノ酸メチオニンをコード)におけるmRNAと相互作用することで、翻訳は開始されます。
      • 6.4.A.3.ii mRNA上のヌクレオチド配列は三重体として読み取られ、これらをコドンと呼びます。
      • 6.4.A.3.iii 各コドンは特定のアミノ酸をコードしており、遺伝子暗号表を用いることでその対応を導き出すことができます。多くのアミノ酸は複数のコドンによってコードされています。
      • 6.4.A.3.iv ほぼすべての生物が同じ遺伝子暗号を使用しており、これはあらゆる生物が共通の祖先を持つことの証拠となっています。
      • 6.4.A.3.v tRNAは、mRNA上のコドンによって指定された場所に正しいアミノ酸を持ち込みます。
      • 6.4.A.3.vi アミノ酸は伸長中のポリペプチド鎖に転移されます。
      • 6.4.A.3.vii このプロセスはmRNAに沿って進行し、停止コドンに到達するまで続きます。
      • 6.4.A.3.viii 翻訳は、新しく合成されたタンパク質が遊離されることで終了します。
      • 除外事項: これらの各ステップに関与する酵素や因子の詳細および名称は、AP試験の範囲外です。
      • 除外事項: 起始コドンAUGを除く、遺伝子暗号の暗記はAP試験の範囲外です。
    • 6.4.A.4 レトロウイルスの遺伝情報は特別なケースであり、逆転写酵素という酵素によってウイルスRNAゲノムがDNAにコピーされることにより可能となる、RNAからDNAへの代替的な情報流があります。このDNAは宿主ゲノムに組み込まれ、新しいウイルス子孫の組立のために転写・翻訳されます。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    翻訳では、mRNAに基づいてタンパク質がリボソームで合成されます。mRNAは3塩基ごとのコドンとして読み取られ、それぞれが1つのアミノ酸を指定します(遺伝暗号)。tRNA(転送RNA)が対応するアミノ酸を運び、リボソームはそれらをペプチド結合でつないでポリピペプチドを形成し、ストップコドンで終了します。これが「中心原理」です:DNA → RNA → タンパク質。

    リボソームがmRNAを読み取ってアミノ酸からタンパク質を合成する様子
    リボソームがmRNAを読み取ってアミノ酸からタンパク質を合成する様子
    6.5

    遺伝子発現の調節

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.5.A: 遺伝子発現を調節する相互作用の種類を説明すること。

    • 6.5.A.1 調節配列とは、調節タンパク質と相互作用して転写を制御するDNAの領域です。一部の遺伝子は恒常的に発現し、他の遺伝子は誘導性です。
    • 6.5.A.2 エピジェネティック変化は、DNAやヒストンの可逆的な修飾を通じて遺伝子発現に影響を与えることがあります。
    • 6.5.A.3 細胞や個体の表現型は、発現している遺伝子の組み合わせと、それらが発現するレベルによって決定されます。
      • 6.5.A.3.i 観察可能な細胞分化は、組織特異的タンパク質の遺伝子の発現によって生じます。
      • 6.5.A.3.ii 発生過程での転写因子の誘導は、順次的な遺伝子発現をもたらします。
      • 6.5.A.3.iii 遺伝子産物の機能と量が発現型を決定します。

    学習目標 6.5.B: 調節配列の位置がその機能とどのように関連しているかを説明すること。

    • 6.5.B.1 原核生物も真核生物も、協調的に調節される遺伝子のグループを持っています。
      • 6.5.B.1.i 原核生物は、誘導性または阻害性システムにおいてオペロンを調節します。
      • 6.5.B.1.ii 真核生物では、同じ転写因子の影響を受けることで、遺伝子のグループが協調的に発現を調節されることがあります。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    細胞はどの遺伝子が発現し、いつ発現するかを制御します。原核生物では、オペロンが遺伝子群のオン・オフを切り替えます。真核生物では、調節は多くのレベルで行われます——どの遺伝子が転写されるか(転写因子、プロモーター、エンハンサー)、RNA処理、翻訳後など。これにより、細胞はDNAを変更することなく環境に応答できます。

    ラックオペロンはラクトースが存在する場合のみ遺伝子をオンにする
    ラックオペロンはラクトースが存在する場合のみ遺伝子をオンにする
    6.6

    遺伝子発現と細胞特分化

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.6.A: 転写因子のプロモーター領域への結合が遺伝子発現および個体の表現型に与える影響を説明すること。

    • 6.6.A.1 RNAポリメラーゼと転写因子は、転写を開始するためにプロモーターまたはエンハンサーのDNA配列に結合します。これらの配列は転写開始部位の上流または下流にあることがあります。
    • 6.6.A.2 負の調節分子は、DNAに結合して転写をブロックすることで、遺伝子発現を抑制します。

    学習目標 6.6.B: 遺伝子発現の調節と細胞・個体の表現型の違いとの関連性を説明すること。

    • 6.6.B.1 遺伝子調節は、遺伝子発現の差を生じさせ、細胞産物および機能に影響を与えます。
    • 6.6.B.2 特定の小さなRNA分子は、遺伝子発現の調節に役割を果たします。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    体中のすべての細胞は同じDNAを持っていますが、異なる遺伝子来表达することで細胞は異なります——差別的遺伝子発現。これが1つの受精卵から多数の特殊化した細胞タイプ(筋、神経、皮膚など)が生み出される仕組みです。発生中のシグナルが特定の遺伝子のオン・オフを調整します。

    幹細胞が特殊化した細胞タイプへ分化する様子
    幹細胞が特殊化した細胞タイプへ分化する様子
    6.7

    突然変異

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.7.A: さまざまなタイプの変異を説明すること。

    • 6.7.A.1 DNA配列の変化は変異であり、生成されるタンパク質の種類や量の変化、およびそれに続く表現型の変化を引き起こすことがあります。DNA変異は、結果として生じる核酸やタンパク質、およびタンパク質がもたらす表現型に対する効果、あるいは効果がない点に基づいて、有益であるか、有害であるか、あるいは中立であることがあり得ます。
      • 6.7.A.1.i ポイント変異は、1つのヌクレオチードが異なるヌクレオチードに置換されることで発生します。
      • 6.7.A.1.ii フレームシフト変異は、1つ以上のヌクレオチードが挿入または欠失し、読み枠がずれることで発生します。
      • 6.7.A.1.iii ノンセンス変異は、ポイント変異が prematurely な停止を招くことで発生します。
      • 6.7.A.1.iv シ lent変異は、ヌクレオチード配列の変化がアミノ酸配列に影響を与えない場合に発生します。
      • 6.7.A.1のための例示:
        • CFTR遺伝子の変異はイオン輸送を乱し、嚢胞性線維症を引き起こします。
        • MC1R遺伝子の変異はポケットマウスの適応的メラニズムをもたらします。
      • 除外事項: 特定の変異とその効果に関する知識は、AP試験の範囲外です。

    学習目標 6.7.B: 遺伝子型の変化がなぜ表現型の変化につながるかを説明すること。

    • 6.7.B.1 DNA複製やDNA修復機構のエラー、ならびに放射線や反応性化学物質などの外部要因は、DNAのランダムな変異を引き起こすことがあります。
      • 6.7.B.1.i 変異が有益であるか、有害であるか、あるいは中立であるかは、環境的文脈に依存します。
      • 6.7.B.1.ii 変異は遺伝的変異の源である。
    • 6.7.B.2 有丝分裂または減数分裂におけるエラーが、表現型の変化をもたらすことがある。
      • 6.7.B.2.i 非分離による染色体数の変化は、三倍体(非整倍体)によって引き起こされる新しい表現型を伴うことが多い。
      • 6.7.B.2.ii 染色体数の変化は、発育上の制限を伴う疾患を引き起こすことがよくある。
      • 6.7.B.2.iii 染色体構造の変異は、遺伝性疾患を引き起こす。
      • 除外事項: 染色体数の変化に関連する特定の疾患に関する知識は、AP試験の範囲外である。

    学習目標 6.7.C: DNA配列の変異が自然選択の対象となる変異に寄与する仕組みを説明せよ。

    • 6.7.C.1 遺伝子型の変化は、自然選択の対象となる表現型に影響を与えることができる。生存と繁殖を促進する遺伝的変化は、環境条件によって選択されることがある。
      • 6.7.C.1.i 原核生物における水平遺伝子導入(DNAの取り込みである変換、ウイルスによる遺伝情報の伝達である転導、細胞間でのDNAの移動である接合、およびDNA分子内・分子間でのDNA断片の移動である転座)は、遺伝的変異を増加させる。
      • 6.7.C.1.ii 関連するウイルスが同じ宿主細胞に感染した場合、遺伝情報を組換えることができる。
      • 6.7.C.1.iii 遺伝的変異を増加させる生殖プロセスは、進化的に保存されており、多様な生物間で共有されている。
      • 6.7.C.1の例示: 鎌状赤血球貧血症

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    突然変異はDNA配列の変化のことです。ポイント突变は1塩基の変化であり、無効突变(サイレント)、ミセンス突变、またはノンスンス突变です。挿入/欠失はフレームシフトを引き起こし、下流のすべてを誤った配列に変えます。生殖細胞での突然変異は遺伝され、有害、中立、あるいは有利になることがあります。有利な変異は自然選択のための多様性を供給します。

    置換、欠失、挿入変異
    置換、欠失、挿入変異

    染色体全体の誤差も表現型を変化させます。 変異は単なる塩基の変化ではありません:有糸分裂や減数分裂の誤差が表現型の変化をもたらすことがあります。染色体が分離しない(非分離)と、配偶体は追加された拷贝またはゼロを受け取り、結果として生じた受精卵は異常な染色体数(異数性)を持ちます。21番三体症候群はその有名な例です。染色体全体には数百の遺伝子が含まれているため、表現型への影響は点変異よりもはるかに広範です。

    English 日本語
    double helix/ˈdʌbl ˈhiːlɪks/ 二重らせん
    nucleotides/ˈnjuːklɪɒtaɪdz/ ヌクレオチド
    complementary base pairing/ˌkɒmplɪˈmentəri beɪs ˈpeərɪŋ/ 塩基対
    antiparallel/ˌæntɪˈpærəlel/ 反平行
    single circular chromosome/ˈsɪŋɡl ˈsɜːkjʊlə ˈkrəʊməsəʊm/ 単一の環状染色体
    multiple linear chromosomes/ˈmʌltɪpl ˈlɪnɪə ˈkrəʊməsəʊmz/ 複数の線状染色体
    condensed by wrapping around proteins called histones/kənˈdenst baɪ ˈræpɪŋ əˈraʊnd ˈprəʊtiːnz kɔːld ˈhɪstəʊnz/ ヒストンと呼ばれるタンパク質に巻き付いて凝縮する
    semiconservatively/ˌsemɪkənˈsɜːvətɪvli/ 半保存的に
    DNA polymerase/ˌdiː en ˈeɪ ˌpɒlɪməˈreɪz/ DNAポリメラーゼ
    Transcription/trænˈskrɪpʃn/ 転写
    messenger RNA/ˈmesɪndʒə ˌɑː en ˈeɪ/ メッセンジャーRNA
    introns/ɪnˈtrɒnz/ インtron
    exons/eɡˈzɒnz/ エクソン
    Translation/trænˈsleɪʃn/ 翻訳
    ribosome/ˈriːbəʊsəʊm/ リボソーム
    codons/ˈkəʊdɒnz/ コドン
    Transfer RNA/ˈtrænsfɜː ˌɑː en ˈeɪ/ 転送RNA
    operons/ˈɒpərənz/ オペロン
    differential gene expression/ˌdɪfəˈrenʃl dʒiːn ekˈspreʃn/ 遺伝子の発現制御
    mutation/mjuːˈteɪʃn/ 突然変異
    frameshift/ˈfreɪmʃɪft/ フレームシフト
    nondisjunction/ˌnɒndɪsˈdʒʌŋkʃn/ 非分離
    aneuploidy/ˈeɪnəplɔɪdi/ 非整倍体
    Biotechnology/ˌbaɪəʊtekˈnɒlədʒi/ バイオテクノロジー
    6.8

    バイオテクノロジー

    シラバス

    永続的理解(BIG IDEA 3 — 情報の保存と伝達): 生命系は、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 6.8.A: DNAの解析や操作における遺伝子工学的技術の利用について説明せよ。

    • 6.8.A.1 遺伝子工学的技術は、DNAおよびRNAの解析や操作に用いられることができる。
      • 6.8.A.1.i ゲル電気泳動は、サイズと電荷に基づいてDNA断片を分離するプロセスである。
      • 6.8.A.1.ii ポリメラー鎖反応(PCR)では、DNAの変性、プライマーの元の鎖へのannealing、および新しいDNA分子の伸長により、DNA断片が増幅される。
      • 6.8.A.1.iii 細菌への変換は、外来DNAを細菌細胞内に導入する。
      • 6.8.A.1.iv DNAシーケンシング技術は、DNA分子内の塩基配列の順序を決定する。通常、これらの技術は、異なるサンプルからのDNA配列を比較できるDNAフィンガープリントを生じる。
      • 6.8.A.1の例示:
        • 増幅されたDNA断片は、生物の同定および系統解析に用いられることがある。
        • DNAの解析は、法医学的識別に用いられることがある。
        • 遺伝子組み換え生物には、トランスジェニック動物が含まれる。
        • ゲノムクローニングは、DNA断片の増殖を可能にする。
      • 除外事項: これらの各遺伝子工学的技術の詳細に関する知識は、AP試験の範囲外である。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    サーマルサイクラーはDNAを増幅するために(PCR)サンプルを繰り返し加熱・冷却する
    サーモサイクラーが試料を繰り返し加熱・冷却してDNAを増幅する(PCR)
    UV光下でのアガロースゲル:DNA断片がサイズ別に分かれ、明るい帯として可視化されている
    UV光下のアガロースゲル:DNA断片がサイズ別に分かれて明るいバンドとして見える

    バイオテクノロジーのツールは遺伝物質を操作します:PCRでDNAをコピーし、ゲル電気泳動でサイズ別にDNA断片を分離し、制限酵素やクローニングで遺伝子を生物間で移動させ、CRISPRで配列を編集します。これらの技術により、遺伝子検査、組み換え生物、および医療治療が可能になります。

    ゲル電気泳動により、DNA断片が長さによって分離される
    ゲル電気泳動は長さに基づいてDNA断片を分離します
    ポリメラーゼ鎖反応(PCR)では、各サイクルでDNA量が倍増する
    ポリメラーゼ鎖反応は各サイクルでDNAを倍増させます

    演習例。 鋳型DNA鎖 3'-TAC GGA TTC-5' が転写されてmRNA 5'-AUG CCU AAG-3' となります。リボソームは3つのコドンを読み取ります:AUG = メチオニン(開始)、CCU = プロリン、AAG = リシン — これにより Met–Pro–Lys をコードします。コドンの第三塩基を変えることはしばしば同じアミノ酸をもたらしますが、これは遺伝子が重複性を持っているため、多くの突然変異の影響が和らぐからです。

    ** DNAの読み取りは個人を識別します。** 特定の非コーディング座標における反復回数が人によって異なるため、DNA解析は法医学的識別に使用できます:PCRでその領域を増幅し、ゲル電気泳動で断片を分離し、バンド位置のパターンを参照サンプルと比較します。一致は確実性ではなく確率に関する声明であるため、1つの座標ではなく複数の座標がテストされます。

    English 日本語
    PCR/ˌpiː siː ˈɑː/ PCR
    gel electrophoresis/dʒel ɪˌlektrəʊfɔːˈriːsɪs/ ゲル電気泳動
    6.8

    試験対策

    • 中心説 DNA → RNA → タンパク質を知っていること:転写はmRNAを作り、翻訳はリボソームで3塩基ごとのコドンとしてそれを読みます。
    • RNAは一本鎖で、Tの代わりにUを使用すること、複製が半保存的であることを覚えていること。
    • 全ての細胞は同じDNAを持っています — 細胞は異なる遺伝子発現(遺伝子発現の差)するため異なります。
    • 変異はDNA配列の変化であり、有害、中性、あるいは有利になる可能性があります(自然選択のための原材料)。
    • バイオテクノロジーのツールとその役割を結びつけること:PCRはDNAをコピーし、ゲル電気泳動はサイズに基づいて断片を分離する。
  • 7

    自然選択

    レッスンを視聴
    7.1

    自然選択の導入

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.1.A: 自然選択の原因について記述せよ。

    • 7.1.A.1 自然選択は、進化の主要なメカニズムである。
    • 7.1.A.2 ダーウィンの自然選択理論によれば、限られた資源に対する競争は、生存率の差をもたらす。より有利な表現型を持つ個体は、生存し、より多くの子を残す可能性が高く、その有利な形質を後世代に伝えることになる。

    学習目標 7.1.B: 自然選択が集団に与える影響について説明せよ。

    • 7.1.B.1 進化的適性は、繁殖的成功によって測定される。
    • 7.1.B.2 生物的要因および非生物的要因の環境は変動することがあり、進化の速度および方向に影響を与える。異なる遺伝的変異が各世代で選択されることがある。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    進化とは、世代を経て集団が持つ継承可能な形質が変化することです。自然選択はその主な駆動力です:個体にはばらつきがあり、一部の形質は継承可能であり、生存できるより多くの子供が生み出され、環境に適した形質を持つ個体がより多く生存して繁殖します。時間が経つと、有益な形質が一般的になっていきます。

    自然選択:最も適応した個体が生存し、繁殖し、そのアルレールを後世に伝える
    自然選択:最も適応した個体が生存・繁殖し、その対立遺伝子を後世に伝える
    English 日本語
    Evolution/ɪvəˈluːʃn/ 進化
    Natural selection/ˈnætʃərəl sɪˈlekʃn/ 自然選択
    7.2

    自然選択

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.2.A: 個体群内の表現型の変異の重要性を説明せよ。

    • 7.2.A.1 自然選択は、個体群内の表現型の変異に対して作用する。
    • 7.2.A.2 環境は変化し、個体群に選択圧をかける。
      • 7.2.A.2 の例: 全球温暖化と開花時期
    • 7.2.A.3 特定の表現型の変異は、ある環境下での生物の適応度を高めたり低下させたりすることがある。
      • 7.2.A.3 の例: 鎌状細胞貧血症; 昆虫のDDT耐性

    学習目標 7.2.B: 細胞内の分子の変異が生物の適応度とどのように関連するかを説明せよ。

    • 7.2.B.1 細胞内の分子の数や種類の変異は、異なる環境下での生存と繁殖の能力を個体群に高めることができる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

     Peppered moth の黒色型(carbonaria)— 工業 melanism は自然選択の古典的なケーススタディである
    ハダカガラガスの黒色型(carbonaria)— 産業 melanism は自然選択の古典的な事例研究です

    選択は変異に対して作用します。適応度とは強さではなく、繁殖成功を意味します。選択には几种類があります:方向性選択(片方の極端を好む)、安定化選択(平均を好む)、および破壊的選択(両方の極端を好む)。環境が「選択」を行うため、ある環境では役立つ形質が別の環境では役立たないこともあります。適切に適合した形質は適応と呼ばれます。

    安定化選択、方向性選択、破壊的選択
    安定化選択、方向性選択、破壊的選択
    探索

    自然選択が集団を変える様子を見る

    自然選択: 環境に適応した個体は生存・繁殖し、有益な形質が広がる。環境を変化させて集団が適応する様子を見る。

    7.3

    人工選択

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.3.A: 人間が個体群内の多様性に与える影響を説明せよ。

    • 7.3.A.1 人工選択を通じて、人間は他の種の変異に影響を与える。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    人工選択では、自然ではなく人間がどの個体が繁殖するかを選び、望ましい形質(作物、家畜、犬)を選択します。これは自然選択と同じ仕組みで働きますが、速く目に見えるため、選択が集団を再構成できることの強力な証拠となっています。

    選択的育種では、望ましい形質が世代を重ねるごとに頻度が増加する
    選抜交配は世代を通じて目的の形質を一般的にします
    7.4

    集団遺伝学

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.4.A: 偶然の出来事が集団の遺伝構成に与える影響を説明せよ。

    • 7.4.A.1 進化は、偶然の出来事によっても推進される。
      • i. 突然変異は、集団に新しい遺伝的変異を加えるランダムなプロセスである。
      • ii. 遺伝的浮動とは、小規模な集団において選択的非起因のプロセスによって対立遺伝子の頻度が変化する現象である。
      • iii. 瓶頸効果とは、集団のサイズが少なくとも1世代にわたって少数の個体まで減少した際に生じる遺伝的浮動の一種である。
      • iv. 創始者効果とは、集団の一部が他の集団から分離した際に生じる遺伝的浮動の一種である。この新しい創始者集団の遺伝子に基づいて、遺伝子や形質の頻度が変化する。
      • v. 移動(遷移)は、遺伝子流動(集団への対立遺伝子の追加や除去)を引き起こすことがある。

    学習目標 7.4.B: 特定の集団の進化における偶然のプロセスの役割を説明せよ。

    • 7.4.B.1 偶然のプロセスは、集団内の対立遺伝子の頻度の変化をもたらすことがある。
      • i. 突然変異は遺伝的変異を生み出し、それが自然選択が作用する表現型の基盤となる。
      • ii. 遺伝的浮動は、小規模な集団が同一種の他の集団から分岐することを可能にする。
      • iii. 2つの集団間の遺伝子流動は、それらが別々の種に分岐することを防ぐ。

    学習目標 7.4.C: 時間の経過に伴う集団の遺伝構成の変化を説明せよ。

    • 7.4.C.1 対立遺伝子の頻度の変化は、集団内で進化が起こったことを示す証拠となる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    集団遺伝学は集団内の対立遺伝子のプールを研究します。進化とは時間経過に伴う対立遺伝子頻度の変化です。自然選択に加え、対立遺伝子頻度は変異(新しい対立遺伝子)、遺伝子流動(移住)、および遺伝的浮動(ランダムな変化、小集団で最も強い — ボトルネック効果と創始者効果)によって変化します。

    人口ボトルネックは遺伝的多様性を減少させる
    集団ボトルネックは遺伝的多様性を減少させる
    7.5

    ハーディ=ワインベルグ平衡

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.5.A: 集団内で対立遺伝子頻度および遺伝子型頻度が変化する条件を説明せよ。

    • 7.5.A.1 ハーディ・ワインベルグ平衡は、進化していない集団における対立遺伝子頻度を記述・予測するためのモデルである。集団または対立遺伝子がハーディ・ワインベルグ平衡にあるための条件は以下の通り:

      • i. 集団のサイズが大きい
      • ii. 移動がない
      • iii. 新しい突然変異がない
      • iv. 無作為交配
      • v. 自然選択がない

      これらの条件は現実には満たされないが、重要な帰無仮説を提供する。

    • 7.5.A.2 進化していない集団における対立遺伝子頻度は、遺伝子型頻度から計算できる。

      • 式: ハーディ・ワインベルグの式 — $p^2 + 2pq + q^2 = 1$; $p + q = 1$、ここで: $p$ = 集団内におけるアルレール 1 の頻度; $q$ = 集団内におけるアルレール 2 の頻度
      • 7.5.A.2 のための例示: 集団内のアルレール頻度のグラフ解析

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    ハーディ=ワインベルグモデルは、集団が進化していないときに期待される対立遺伝子頻度と遺伝子型頻度を示します。対立遺伝子頻度が $p$ と $q$ ($p+q=1$)の場合:

    $$p^2 + 2pq + q^2 = 1,$$
    ここで $p^2$ と $q^2$ はホモ接合体、$2pq$ はヘテロ接合体を表します。この法則は5つの条件(選択なし、変異なし、遷移なし、随机交配、大集団)の下でのみ成立します。実際のデータが予測と異なる場合、集団は進化していることを意味します。

    計算例。 集団の中で $16\%$ の個体が劣性形質を示すため、$q^2=0.16$ および $q=\sqrt{0.16}=0.4$ となる。したがって、$p=1-q=0.6$ である。予測されるキャリア頻度(ヘテロ接合体)は $2pq=2(0.6)(0.4)=0.48$ 、すなわち $48\%$ であり、ホモ接合優性個体は $p^2=0.6^2=0.36$ 、すなわち $36\%$ である。検算として、$0.36+0.48+0.16=1$ が成立する。これが標準的な手順である:劣性形質 $\to q^2\to q\to p\to$其余の値を導くこと。

    ハーディ=ヴァインベルグ:アルレール頻度 p と q が、遺伝子型頻度 p², 2pq, q² を生む
    ハーディ=ヴァインベルグ:アルレール頻度 p と q が、遺伝子型頻度 p², 2pq, q² を生む
    探索

    交配におけるアレル頻度

    ハーディ・ワインベルグは進化していない集団における遺伝子型頻度($p^2+2pq+q^2$)を予測する。ペンネット正方形は集団レベルでの同じアレルの組み合わせを示す。

    7.6

    進化の証拠

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.6.A: 進化の証拠となるデータの種類を説明する。

    • 7.6.A.1 進化は、地理的、地質学的、物理的、生化学的、および数学的なデータなど、多岐にわたる学問分野からの科学的証拠によって支持されている。

    学習目標 7.6.B: 形態学的、生化学的、および地質学的なデータが、生物が時間とともに変化してきたことをどう裏付けているかを説明する。

    • 7.6.B.1 現生および絶滅生物由来の分子、形態、遺伝的証拠は、進化に対する私たちの理解を深める。
      • i. 化石は多様な方法で年代測定が可能である。これには、1) 化石が発見された岩層の年齢、2) カルボン-14を含む同位体の崩壊速度、3) 地理的データが含まれる。
      • ii. 痕跡器官を含む形態的同族性は、共通祖先の証拠となる。
    • 7.6.B.2 DNA塩基配列とタンパク質アミノ酸配列の比較は、進化と共通祖先の証拠となる。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Archaeopteryx化石:羽毛と爬虫類の特徴 — 共通祖先の証拠
    Archaeopteryx化石:羽毛と爬虫類の特徴 — 共通祖先の証拠

    複数の独立した根拠が進化を裏付けている:化石記録、相同構造(共通祖先に由来する共有解剖学的特徴)、痕跡器官、共有される胚発生、および分子レベルの証拠——ほぼ普遍的な遺伝コードや一致するDNA/タンパク質配列などである。

    7.7

    共通祖先

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.7.A: 真核生物全体的の共通祖先を示す、細胞レベルおよび分子レベルでの構造・機能証拠を説明する。

    • 7.7.A.1 構造および機能証拠は、真核生物全体的の共通祖先を示している。これらの証拠には以下が含まれる:
      • i. 膜で覆われた小器官
      • ii. 直線状染色体
      • iii. イントロンを含む遺伝子

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    すべての生命は共通祖先を持ち、そのことは普遍的な特徴によって示されている:同じDNA/RNAメカニズム、同じ遺伝コード、リボソーム、そしてあらゆる生物に共通する主要代謝経路である。2つの種が共有する特徴や配列が多いほど、それら分岐した時期は最近である。

    Archaeopteryx:移行化石は主要なグループをつなぎ、共通祖先を支持している
    Archaeopteryx:移行化石は主要なグループをつなぎ、共通祖先を支持している
    7.8

    継続的な進化

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.8.A: 進化が全ての生き物において進行中のプロセスであることを説明する。

    • 7.8.A.1 全ての種は進化し、現在も進化し続けている。例として以下が挙げられる:
      • i. 時間の経過に伴うゲノムの変化
      • ii. 化石記録における連続的な変化
      • iii. 抗生物質、農薬、除草剤、または化学療法薬に対する耐性の進化
      • iv. 病原体の進化による新発感染症の発生

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    抗生物質感受性培地:透明な輪はどの抗生物質が細菌を殺すかを示している
    抗生物質感受性培地:透明な輪はどの抗生物質が細菌を殺すかを示している

    進化は進行中であり、観察可能である:抗生物質耐性菌、農薬耐性昆虫、急速繁殖種の急速な変化など。環境が絶えず変化するため、自然選択も働き続け、進化には終点がない。

    自然選択によって集団内での抗生物質耐性が広がる様子
    自然選択によって集団内での抗生物質耐性が広がる様子
    7.9

    系統樹

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.9.A: 進化的な関係性を推定するために使用できる証拠の種類を説明する。

    • 7.9.A.1 系統樹およびクラドグラムは、検証可能な系統間の仮説的な進化的関係を示す。
    • 7.9.A.2 系統樹は、化石や分子時計によって較正された時間に対する変化の量を示すが、クラドグラムは時間軸やグループ間の進化的差異を示さない。
    • 7.9.A.3 進化過程で獲得または喪失した形質を用いて、系統樹およびクラドグラムを構築することができる。外群(アウトグループ)は、系統樹またはクラドグラムの他の生物との間で最も近縁でない系統を表す。
      • i. 共有派生形質は複数の系統に存在することがあり、共通祖先を示す。これらは系統樹およびクラドグラムの構築に有用である。
      • ii. 系統樹またはクラドグラムの構築において、分子データは形態的形質よりもより正確で信頼性が高い証拠を提供することが一般的である。

    学習目標 7.9.B: 系統樹およびクラドグラムを用いて、進化的な親縁関係をどのように推定するかを説明する。

    • 7.9.B.1 系統樹およびクラドグラムは、発生した種分化を示すために使用できる。系統樹上の節点(ノード)は、2つのグループまたは系統の最近の共通祖先を表す。
    • 7.9.B.2 系統樹およびクラドグラムは、現生または化石種の形態的類似性、ならびにDNAおよびタンパク質配列の類似性から構築できる。
    • 7.9.B.3 系統樹およびクラドグラムは、証拠に基づいて絶えず修正される仮説を表す。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    系統樹(クラドグラム)は進化的関係を図示し、枝分かれ点は共通祖先を表し、共有された派生形質が関連する種をグループ化する。系統樹は仮説であり、新しいデータ(特に分子データ)が入るたびに修正される。

    生命の樹:系統樹は共通起源からの共有祖先に基づいて生物をグループ化する
    生命の樹:系統樹は共通起源からの共有祖先に基づいて生物をグループ化する
    7.10

    種形成

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 1 — 進化): 進化のプロセスは生命の多様性と統一性を駆動する。

    学習目標 7.10.A: 新しい種が生じる条件について記述せよ。

    • 7.10.A.1 2つの集団が互いに生殖的に隔離されることで、種形成が起こる。
    • 7.10.A.2 生物学的種概念は、有性生殖を行う生物に対して広く用いられる種の定義を提供する。これは、種とは、交尾して生育可能な fertile な子孫を生み出し、遺伝情報を交換することのできる集団として定義されることを示している。

    学習目標 7.10.B: 異なる生態的条件における進化および種形成の速度について記述せよ。

    • 7.10.B.1 断続的平衡とは、長期の停滞期之后に進化が急速に起こる状態である。漸進論とは、進化が数十万〜数百万年にわたってゆっくりと起こる状態である。
    • 7.10.B.2 分化進化とは、新たな生息地への適応が表現型の多様化をもたらす場合に起こる。新たな生息地が利用可能になる時期には、適応放散に伴って種形成の速度が特に速くなることがある。
    • 7.10.B.3 収斂進化とは、類似した選択圧が異なる集団や種において類似した表現型的適応をもたらす場合に起こる。

    学習目標 7.10.C: 種形成を駆動するプロセスおよびメカニズムについて説明せよ。

    • 7.10.C.1 同所種形成とは、地理的な重複がある集団で起こる。異所種形成とは、地理的に隔離された集団で起こる。
    • 7.10.C.2 様々な前受精的および後受精的メカニズムが、生殖的隔離を維持し、集団間の遺伝流を防ぐことができる。
    • 7.10.Cの例示: ハワイ産Drosophila; カリブ海産Anolis; りんごバグRhagoletis

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    種形成は新たな種の起源であり、通常、集団が生殖的に隔離されて分化することによって起こる。異所種形成は地理的分断に伴うものであり、同所種形成はそのような分断なしに起こる。集団が交尾できなくなった時点で、それらは別の種となる。

    異所種形成と同所種形成
    異所種形成と同所種形成
    English 日本語
    Speciation/ˌspiːʃɪˈeɪʃn/ 種形成
    reproductively isolated/rɪprəˈdʌktɪvli ˈaɪsəleɪtɪd/ 生殖的に隔離される
    diversity/daɪˈvɜːsɪti/ 多様性
    endosymbiosis/ˌendəʊˌsɪmbaɪˈəʊsɪs/ 内共生
    7.11

    集団内の多様性

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 4 — システムの相互作用): 生物システムは互いに相互作用し、これらのシステムおよびその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 7.11.A: 一種または集団の遺伝的多様性が、環境圧に耐える能力にどう影響するかを説明せよ。

    • 7.11.A.1 個体群内の変異の程度は、個体群動態に影響を与える。
      • i. 環境の変化に対する個体群の適応能力は遺伝的多様性に依存する。遺伝的多様性が少ない種や個体群は、減少または絶滅のリスクにさらされる。
      • ii. 遺伝的に多様な個体群は、環境変化に対する回復力が高く、環境圧に耐えうる個体が含まれる可能性が高い。
      • iii. ある環境条件下で有利な対立遺伝子も、選択圧が異なる別の環境下では有害になることがある。
      • 7.11.A.1 の例: カリフォルニアコンドル; ブラックフットフェレット; プレアリーチキン; ポテトラウター病; トウモロコシ錆病; 遺伝的多様性と自然選択; 細菌の抗生物質耐性(多様な個体群内でもすべての個体が疾病に感染するわけではない)

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    遺伝的多様性は集団が変化に耐えるのを助ける——条件が変わった場合、いくつかの変異型がすでに適応しているかもしれない。低い多様性(絶危種の例など)は集団を脆弱にする。変異は突然変異や減数分裂・有性生殖による組み換えから生じる。

    不連続変異と連続変異
    不連続変異と連続変異
    English 日本語
    variation/ˌveərɪˈeɪʃn/ 変異
    Fitness/ˈfɪtnəs/ 適応度
    adaptations/ˌædæpˈteɪʃnz/ 適応
    artificial selection/ˌɑːtɪˈfɪʃl sɪˈlekʃn/ 人工選択
    Population genetics/ˌpɒpjʊˈleɪʃn dʒɪˈnetɪks/ 集団遺伝学
    allele frequencies/əˈliːl ˈfriːkwənsiz/ アレル頻度
    gene flow/dʒiːn fləʊ/ 遺伝子流動
    genetic drift/dʒɪˈnetɪk drɪft/ 遺伝的浮動
    Hardy–Weinberg/ˈhɑːdi ˈwaɪnbɜːɡ/ ハーディ=ワインバーグ
    fossil record/ˈfɒsl ˈrekɔːd/ 化石記録
    homologous structures/həˈmɒləɡəs ˈstrʌktʃəz/ 相同器官
    vestigial structures/ˈvestɪdʒl ˈstrʌktʃəz/ 痕跡器官
    common ancestor/ˈkɒmən ˈænsestə/ 共通祖先
    phylogenetic tree/ˌfaɪləʊdʒˈnetɪk triː/ 系統樹
    7.12

    地球上の生命の起源

    シラバス

    持続的理解(BIG IDEA 4 — システムの相互作用): 生物システムは互いに相互作用し、これらのシステムおよびその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 7.12.A: 地球における生命の起源を支持する科学的証拠を説明せよ。

    • 7.12.A.1 地球における生命の起源は、科学的証拠によって裏付けられている。
      • i. 地質学的証拠は、地球における生命の起源に関するモデルを補強する。
      • ii. 地球は約 4.6 億年前(bya)に形成された。生命にとって環境があまりにも過酷だったのは約 3.9 bya までであり、生命の最初の化石証拠は 3.5 bya に遡る。これらの証拠を合わせると、生命の起源に関する妥当な年代範囲が得られる。
    • 7.12.A.2 RNA世界仮説は、RNAが最初の遺伝物質であった可能性を提案している。この仮説には以下の3つの前提がある:
      • i. 何らかの時点で、RNAの複製によって遺伝的な連続性が保証されていた。
      • ii. 塩基対結合は複製に必要である。
      • iii. 遺伝的にコードされたタンパク質は触媒として関与していなかった。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    証拠は初期地球の環境が単純な有機分子(ミラー=ユリー型実験のようなもの)を形成できたことを示唆しており、それらがポリマーに組み合わさり、自己複製可能なRNA(「RNA世界」)となり、最終的に膜で包まれた細胞になったと考えられる。最初の細胞は原核生物であり、真核生物は後になって内共生によって現れた。

    ストロマトライト:層状微生物マットは地球上の最も古い生命の証拠の一つ
    ストロマトライト:層状微生物マットは地球上の最も古い生命の証拠の一つ
    熱水噴出孔:化学物質に富んだ熱水が生命起源時の初期代謝を駆動した可能性がある
    熱水噴出孔:化学物質に富んだ熱水が生命起源時の初期代謝を駆動した可能性がある
    7.12

    試験対策

    • 自然選択を明確に述べる:変異 → 生存率と繁殖数の差 → 有利な形質が一般的になる。
    • 適応度(フィットネス)=繁殖成功率であり、力や健康ではない。
    • 進化とは集団における対立子頻度の変化であり、個体が進化することはない。
    • ハーディ=ワインベルグの法則($p^2+2pq+q^2=1$)を使用する:劣性形質 $q^2\to q\to p$ から始める。
    • 独立した証拠(化石、相同構造、DNA)を引用し、生殖的隔離を通じて種形成を説明する。
  • 8

    生態学

    レッスンを視聴
    8.1

    Responses to the Environment

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 8.1.A: 生物の行動的・生理的反応が、内部または外部環境の変化とどのように関連しているかを説明する。

    • 8.1.A.1 生物は、行動的および生理的メカニズムを通じて環境の変化に応答する。
      • 除外事項: 特定の行動的または生理的メカニズムに関する知識はAP試験の範囲外である。
      • 8.1.A.1の例示:
        • 植物の光周期現象および光屈性
        • 動物の走性以及趋性(タクシスおよびキネシス)
        • 夜行性と昼行性の活動
    • 8.1.A.2 生物は、内部の変化や外部の刺激に対して互いに情報を交換し、これが行動を変化させることがある。
      • 8.1.A.2の例示:
        • 闘争または逃走反応
        • 捕食者からの警告
        • 草食動物による摂食に対する植物の反応

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 8.1.B: 生物の行動的反応が、その総適応度にどのように影響し、個体群の成功に寄与しうるかを説明する。

    • 8.1.B.1 生物は、視覚的、聴覚的、触覚的、電気的、および/または化学的信号などの多様なメカニズムを通じてコミュニケーションを行う。
      • i. 生物は、他の生物の行動に変化をもたらす多様な信号行動を持っており、結果として繁殖成功率の差を生むことがある。
      • ii. 動物は、優位性の表示、餌の探索、領土の確立、そして繁殖成功率の確保のために信号を使用する。
      • 除外事項: 特定のコミュニケーションメカニズムに関する知識はAP試験の範囲外である。
      • 8.1.B.1の例示:
        • 哺乳類の領土標示
        • 開花植物および動物の体色
        • 鳥のささり声
        • 動物の群れ行動
        • 捕食者への警告
    • 8.1.B.2 情報への反応や情報の伝達は、自然選択と進化にとって不可欠である。
      • i. 適応度は、生存と繁殖の成功を高める先天的および学習された行動を好む。
      • ii. 協力的な行動は、個体の適応度と集団の生存率を高める傾向がある。
      • 除外事項: 多様なコミュニケーションやコミュニティ行動システムの詳細は、AP試験の範囲外である。
      • 8.1.B.2.iに関する例示:
        • 親と子孫の相互作用
        • 求愛と交尾の行動
        • ミツバチや他の動物による採食
      • 8.1.B.2.iiに関する例示:
        • 動物の群れ行動
        • 動物の群集、群飛、魚群行動
        • 捕食者からの警告
        • 昆虫のコロニー形成や群れ行動
        • 血縁選択

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Organisms sense and respond to their surroundings in ways that aid survival and reproduction. Behaviors may be innate (inherited, like reflexes and instincts) or learned. Responses such as migration, hibernation, and phototropism, and signals between organisms, are shaped by natural selection because they improve fitness.

    Sunflowers face the light: organisms detect and respond to environmental stimuli
    Sunflowers face the light: organisms detect and respond to environmental stimuli

    The behaviours the CED lists by name

    These are the illustrative behaviours an exam question builds its scenario from, so learn what each one is and what it buys the organism:

    Behaviour What it is Why it aids fitness
    taxis 趋性 movement directed towards or away from a stimulus reaches food, light or moisture, or escapes a hazard
    kinesis 动性 a change in the rate of random movement, with no direction keeps the animal in favourable conditions by moving less there and more elsewhere
    nocturnal and diurnal activity 夜行性与昼行性 being active at night, or by day avoids predators or heat, and matches activity to when food is available
    territorial marking 领域标记 scent, sound or visual marks that claim an area secures food, nesting sites and mates without repeated fighting
    coloration 体色 pigmentation in animals and flowering plants warning, camouflage, mate attraction — and in flowers, attracting pollinators
    foraging 觅食 by bees and others searching for and collecting food efficient foraging returns more energy than it costs, which is what selection acts on

    ⚠️ Taxis and kinesis are the pair most often confused. Taxis has a direction: the woodlouse walks towards the damp. Kinesis has only a rate: the woodlouse moves quickly and turns often in dry air and slows down in damp air, so it ends up in the damp without ever steering there.

    Life-history strategy 生活史策略 is the pattern of when an organism grows, reproduces and dies, and it too is shaped by selection: a biennial plant stores resources in its first year and flowers in its second; reproductive diapause pauses development until conditions improve, so offspring arrive when they can survive. Both trade the timing of reproduction against the chance that it succeeds.

    English 日本語
    taxis/ˈtæksiz/ 走性
    kinesis/kəˈniːsɪs/ キネシス
    nocturnal and diurnal activity/nɒkˈtɜːnl ænd ˈdɪɜːnl ækˈtɪvɪti/ 夜行性と昼行性の活動
    territorial marking/ˌterɪˈtɔːrɪəl ˈmɑːkɪŋ/ 領域標識付け
    coloration/ˌkʌləˈreɪʃn/ 体色
    foraging/ˈfɒrɪdʒɪŋ/ 採餌
    Life-history strategy/laɪf ˈhɪstəri ˈstrætədʒi/ ライフヒストリー戦略
    8.2

    Energy Flow Through Ecosystems

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 8.2.A: 生物がエネルギーを取得し利用するための戦略を説明する。

    • 8.2.A.1 生物は、組織化、成長、繁殖、恒常性の維持にエネルギーを用いる。
      • i. 生物は体温と代謝を調節するために異なる戦略を用いる。温血動物は代謝によって生成される熱エネルギーを用いて恒常的な体温を維持する。冷血動物は体内で体温を効率的に維持する機構を持たないが、日光や陰影へ移動したり、他の個体と集団したりすることで、行動的に体温を調節することがある。
      • ii. エネルギーの正味増は、エネルギーの貯蔵、生物の成長、および繁殖産出量の増加につながる。
      • iii. エネルギーの正味減少は、質量の喪失、繁殖産出量の低下、そして最終的には生物の死につながる。
    • 8.2.A.2 異なる生物は、エネルギーの利用可能性に応じて多様な繁殖戦略を用いる。一部の生物は、エネルギーの利用可能性に応じて無性生殖と有性生殖を交互に行う。
      • 8.2.Aに関する例示:
        • 動物と植物の季節的繁殖
        • 生活史戦略(二年生植物、生殖休止期)

    学習目標 8.2.B: エネルギーの流れと物質の循環が栄養段階をどのように通るかを説明する。

    • 8.2.B.1 生態学的な組織レベルには、個体群、群落、エコシステム、生物圏が含まれる。
    • 8.2.B.2 エネルギーはエコシステム内を流れ、物質と養分は地球化学サイクルを通じて環境と生物の間を循環する。これらのサイクルは生命にとって不可欠であり、各サイクルは物質の保存則を示している。これらのサイクルは相互依存している。
    • 8.2.B.3 地球化学サイクルには、非生物的・生物学的な蓄積庫、および蓄積庫間の物質循環プロセスが含まれる。
    • 8.2.B.4 水循環(水文循環)には、水圏内における水の移動と貯留が含まれる。蓄積庫には海洋、地表水、大気、生物が含まれる。プロセスには蒸発、凝結、降水、蒸散がある。
    • 8.2.B.5 炭素循環では、炭素原子が地球の生物圏内で炭水化物として生物に取り込まれ、二酸化炭素 $\left(\mathrm{CO_2}\right)$ として大気に戻されながら再循環する。最も高い組織レベルにおいて、炭素循環は4つの部分に単純化できる:光合成、細胞呼吸、分解、燃焼。
    • 8.2.B.6 窒素循環には、窒素固定、同化、アンモニア化、硝化、脱窒のいくつかのステップが含まれる。これらのステップは土壌内の微生物によって行われる。窒素の最大の蓄積庫は大気である。窒素固定では、窒素ガス $\left(\mathrm{N_2}\right)$ がアンモニア $\left(\mathrm{NH_3}\right)$ に固定され、土壌溶液から水素イオンを取得することでアンモニウム $\left(\mathrm{NH_4^+}\right)$ にイオン化する。
    • 8.2.B.7リン酸循環では、岩石の風化によって土壌や地下水にリン酸 $\left(\mathrm{PO_4^{3-}}\right)$ が放出される。生産者はリン酸を取り込み、それが生物分子に組み込まれる。消費者は生産者を食べ、リン酸を動物に移送する。リン酸は、生物量の分解や排泄によって土壌に戻る。また、分解された有機物からの分解を通じて、リン酸は環境に再び取り込まれることもある。

    学習目標 8.2.C: エネルギー利用可能性の変化が個体群、群落、およびエコシステムに与える影響を説明する。

    • 8.2.C.1 エネルギー利用可能性の変化は、個体群サイズの变化をもたらすことがある。
    • 8.2.C.2 エネルギー利用可能性の変化は、エコシステムの攪乱をもたらすことがある。
      • i. 太陽光などのエネルギー資源の変化は、栄養段階の数と規模に影響を与える。栄養段階には、生産者、一次・二次・三次・四次消費者、分解者が含まれる。
      • ii. 特定の地理的領域における生産者の生物量や数の変化は、他の栄養段階の数と規模に影響を与える。

    学習目標 8.2.D: 自営生物と異営生物の活動が、エコシステム内でのエネルギーの流れを可能にする方法を説明する。

    • 8.2.D.1 自営生物は、環境中の物理的または化学的源からエネルギーを捕獲する。
      • i. 光合成生物は、光に含まれるエネルギーを捕獲し、一次生産性に寄与する。
      • ii. 化学合成生物は、環境中に存在する小さな無機分子からエネルギーを捕獲する。これは酸素がない状態でも起こり得る。
    • 8.2.D.2 肉食動物、草食動物、雑食動物、分解者、腐食物質摂取生物を含む異営生物は、エネルギー源として炭水化物、脂質、タンパク質を代謝する。異営生物は、自営生物由来の有機物を摂取することで炭素化合物に含まれるエネルギーを捕獲し、物質を自身の組織に取り込む。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Energy enters most ecosystems 生态系统 as sunlight, is captured by producers 生产者 (photosynthesizers), and passes to consumers 消费者 along a food chain 食物链. Each level is a trophic level 营养级. Only about 10% of energy transfers up each level (the rest is lost as heat), so food chains are short and producers are the most abundant. Energy flows through and is lost, while matter (carbon, nitrogen) cycles.

    Only about 10% of the energy passes to the next trophic level
    Only about 10% of the energy passes to the next trophic level

    Worked example. Suppose producers capture $10{,}000\ \text{kcal}$. Applying the $10\%$ rule, primary consumers receive about $1{,}000\ \text{kcal}$, secondary consumers $100\ \text{kcal}$, and tertiary consumers only $10\ \text{kcal}$. Losing $90\%$ as heat at every step is exactly why food chains rarely exceed four or five levels – there is too little energy left to support another.

    探索

    食物連鎖でエネルギーを上昇させる

    エネルギーの約**10%**のみが次の栄養階層へ移され、残りは熱として失われる。これが食物鎖が短く、上位捕食者が少ない理由である。

    English 日本語
    ecosystems/ˈiːkəʊsɪstəmz/ 生態系
    producers/prəˈdjuːsəz/ 生産者
    consumers/kənˈsuːməz/ 消費者
    food chain/fuːd tʃeɪn/ 食物鎖
    trophic level/ˈtrəʊfɪk ˈlevl/ 栄養段階
    8.3

    Population Ecology

    シラバス

    Big Idea 3 — 情報の保存と伝達: 生命システムは、生命過程に不可欠な情報を保存し、検索し、伝達し、応答する。

    学習目標 8.3.A: 個体群の成長動態に影響を与える要因を説明する。

    • 8.3.A.1 個体群は、互いに相互作用し、環境とも複雑に相互作用する同じ種の個体で構成される。
    • 8.3.A.2 生物の多くの適応は、特定の環境におけるエネルギーと物質の獲得および利用に関係している。
      • i. 個体群の成長動態は、出生率、死亡率、個体数によって決まる。
        • 式: 個体群の成長 — $\dfrac{dN}{dt} = B - D$ ここで $dt$ = 時間の経過量; $B$ = 出生率; $D$ = 死亡率; $N$ = 個体数; $dN$ = 個体数の変化量
      • ii. 制限のない繁殖により、個体群は指数関数的な成長を示す。
        • 式: 指数関数的成長 — $\dfrac{dN}{dt} = r_{max} N$ ここで $dt$ = 時間の経過量; $N$ = 個体数; $dN$ = 個体数の変化量; $r_{max}$ = 個体群の最大一人あたり成長率

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    A population 种群 is the individuals of one species in an area. Its growth depends on birth, death, immigration, and emigration. Exponential growth 指数增长 ($J$-shaped) happens with unlimited resources; logistic growth 逻辑斯蒂增长 ($S$-shaped) levels off at the carrying capacity 环境容纳量 $K$ – the maximum the environment can sustain – following $\dfrac{dN}{dt}=r_{\max}N\dfrac{K-N}{K}$.

    Population growth: lag, exponential, then levelling off at the carrying capacity
    Population growth: lag, exponential, then levelling off at the carrying capacity

    Worked example. A population has $r_{\max}=0.5\ \text{yr}^{-1}$, carrying capacity $K=1000$, and current size $N=400$. Then $\dfrac{dN}{dt}=0.5\times400\times\dfrac{1000-400}{1000}=0.5\times400\times0.6=120$ individuals per year. The $\frac{K-N}{K}$ term is why growth is fastest near $N=K/2$ and slows toward zero as $N$ approaches $K$.

    探索

    carrying capacity に達するまで集団を成長させる

    集団は小さい時に速く増え、** carrying capacity ** $K$ に近づくにつれて減速する——論理的成長。成長率を上げると水平になる様子を見る。

    English 日本語
    population/ˌpɒpjʊˈleɪʃn/ 人口
    Exponential growth/ˌekspəˈnenʃl ɡrəʊθ/ 指数関数的増減
    logistic growth/ləˈdʒɪstɪk ɡrəʊθ/ ロジスティック成長
    carrying capacity/ˈkæriɪŋ kəˈpæsɪti/ 環境収容力
    8.4

    Effect of Density on Populations

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 8.4.A: 個体群の密度が環境中の資源の可用性によってどのように影響を受け、決定されるかを説明する。

    • 8.4.A.1 環境収容力とは、生態系の総利用可能な資源によって持続的に支えられる種の豊度である。
    • 8.4.A.2 密度依存的因子および密度非依存的因子による成長の限界が課されると、通常、ロジスティクス成長モデルが生じる。
      • 式: ロジスティクス成長 — $\dfrac{dN}{dt} = r_{max} N \left( \dfrac{K - N}{K} \right)$ ここで $dt$ = 時間の経過量; $N$ = 個体数; $dN$ = 個体数の変化量; $r_{max}$ = 個体群の最大一人あたり成長率; $K$ = 環境収容力

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Some factors depend on crowding, others do not:

    • Density-dependent 密度制约 factors intensify as a population grows – competition, predation, disease.
    • Density-independent 非密度制约 factors act regardless of density – weather, natural disasters.

    These factors regulate population size around the carrying capacity.

    A dense deer herd: density-dependent factors such as disease and food competition intensify as numbers rise
    A dense deer herd: density-dependent factors such as disease and food competition intensify as numbers rise
    English 日本語
    Density-dependent/ˈdensɪti dɪˈpendənt/ 密度依存的
    Density-independent/ˈdensɪti ˌɪndɪˈpendənt/ 密度非依存的
    8.5

    Community Ecology

    シラバス

    Big Idea 2 — エネルギー学: 生物系はエネルギーと分子の構成要素を用いて成長し、繁殖し、動的な恒常性を維持する。

    学習目標 8.5.A: 種の組成および多様性に基づいて、群落の構造を説明する。

    • 8.5.A.1 群落の構造は、種の組成および種多様性の観点から測定され、記述される。
      • 式: Simpsonの多様性指数 — $\text{Diversity Index} = 1 - \sum \left( \dfrac{n}{N} \right)^2$ ここで $n$ = 特定の種の個体の総数; $N$ = 全種の個体の総数

    学習目標 8.5.B: 個体群内および個体群間の相互作用が群落の構造にどのように影響するかを説明する。

    • 8.5.B.1 群落は、異なる種の個体群の相互作用の集まりであり、それらの個体群間の相互作用に基づいて時間とともに変化する。
    • 8.5.B.2 個体群間の相互作用は、それらが群落内でエネルギーと物質にアクセスする方法を決定する。
    • 8.5.B.3 相互作用する個体群間の関係は、正の影響と負の影響によって特徴づけられ、モデル化できる。例として、捕食者/被捕食者の相互作用、協同、栄養カスケード、ニッチ分割がある。
    • 8.5.B.4 競争、捕食、共生(寄生、相利、片利を含む)は、個体群の動態を駆動することがある。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Clownfish among sea-anemone tentacles — a textbook mutualism
    Clownfish among sea-anemone tentacles — a textbook mutualism

    A community 群落 is all the interacting populations in an area. Key interactions: competition 竞争 (for shared resources), predation 捕食, symbiosis 共生 – mutualism (both benefit), commensalism (one benefits, other unaffected), and parasitism (one benefits, other harmed). These relationships shape which species coexist.

    A food web links several food chains together
    A food web links several food chains together
    English 日本語
    community/kəˈmjuːnɪti/ 群落
    competition/ˌkɒmpəˈtɪʃn/ 競争
    predation/prɪˈdeɪʃn/ 捕食
    symbiosis/ˌsɪmbaɪˈəʊsɪs/ 共生
    8.6

    Biodiversity

    シラバス

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 8.6.A: 生態系の多様性と環境変化に対する回復力との関係を説明する。

    • 8.6.A.1 構成要素が少なく、構成要素間の多様性が低い自然および人工的な生態系は、環境の変化に対して回復力が低いことが多い。
    • 8.6.A.2 キースピーシス、生産者、そして不可欠な非生物的要因および生物的要因は、生態系の多様性を維持するために寄与する。

    学習目標 8.6.B: 生態系のどの構成要素を追加または除去しても、その全体としての短期間および長時間の構造にどのように影響するかを説明する。

    • 8.6.B.1 キースピーシスが生態系に与える効果は、その生態系内の豊富さに対して不均衡に大きい。彼らが生態系から除去されると、生態系は崩壊することが多い。

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Coral reef outcrop: high biodiversity in a productive marine ecosystem
    Coral reef outcrop: high biodiversity in a productive marine ecosystem

    Biodiversity 生物多样性 is the variety of life – genes, species, and ecosystems. Higher diversity generally makes a community more resilient 有韧性, better able to withstand and recover from disturbance. A keystone species 关键种 has an outsized effect, so losing it can collapse the community.

    Biodiversity at three levels: genetic, species, and habitat
    Biodiversity at three levels: genetic, species, and habitat
    English 日本語
    Biodiversity/ˌbaɪəʊdaɪˈvɜːsɪti/ 生物多様性
    resilient/rɪˈsɪlɪənt/ 回復力
    keystone species/ˈkiːstəʊn ˈspiːsiːz/ キーストーン種
    8.7

    Disruptions in Ecosystems

    シラバス

    Big Idea 1 — 進化: 進化のプロセスが生命の多様性と統一性を推進する。

    学習目標 8.7.A: 環境と個体群内のランダムまたは既存の変異との相互作用を説明する。

    • 8.7.A.1 適応とは、選択によって好まれ、特定の環境において生物に利益をもたらす形質として発現する遺伝的変異である。
    • 8.7.A.2 複合優位とは、複合体型が単合体優性または単合体隐性のいずれよりも高い相対適性を持つことである。
    • 8.7.A.3 変異は、特定の環境圧によって誘導されるものではない。

    Big Idea 4 — システムの相互作用: 生物系は相互作用し、これらのシステムとその相互作用は複雑な性質を示す。

    学習目標 8.7.B: 外来種が生態系の動態に与える影響を説明する。

    • 8.7.B.1 外来種の意図的または無意識の導入により、その種は捕食者や競合者がいない新しいニッチを利用したり、在来種に対して資源を巡って競争に勝利したりすることが可能になる。
      • 8.7.B.1 の具体例:
        • クズ
        • ゼンマイガイ

    学習目標 8.7.C: 生態系の構造および動態を変化させる人間活動について説明する。

    • 8.7.C.1 人間の影響は、局所的および世界的レベルでの変化を加速する。これらの活動は、以下のinctionを引き起こすような生態系の変化を促進することがある:
      • i. 生物濃縮
      • ii. 富栄養化
      • 8.7.C.1 の具体例:
        • オランダエール病
        • ポテトブルート

    学習目標 8.7.D: 地質学的および気象学的活動が生態系の構造および動態の変化をもたらす理由を説明する。

    • 8.7.D.1 地質学的および気象学的事象は、生息地の変化および生態系の分布に影響を与える。生物地理学的研究はこれらの変化を示す。
      • 8.7.D.1 の具体例:
        • 地球規模の気候変動
        • 伐採
        • 都市化
        • 単一栽培
        • エル・ニーニョ現象
        • 大陸漂移説
        • 石衝突による恐竜の絶滅

    出典: College Board AP コースおよび試験説明書

    Deforested landscape — habitat loss is a major disruption to ecosystems
    Deforested landscape — habitat loss is a major disruption to ecosystems

    Ecosystems change from natural and human causes – climate shifts, invasive species, habitat loss, and pollution. A disturbance can trigger ecological succession 生态演替 (the community rebuilds over time). Because species are interconnected, a change to one – especially a keystone or a trophic level – can ripple through the whole ecosystem.

    Deforestation lowers biodiversity and causes erosion, flooding, and higher CO2
    Deforestation lowers biodiversity and causes erosion, flooding, and higher CO2
    English 日本語
    ecological succession/ˌekəˈlɒdʒɪkl səkˈseʃn/ 生態的遷移
    8.7

    Exam tips

    • Apply the 10% rule: about 90% of energy is lost at each trophic level, so food chains are short.
    • Distinguish exponential ($J$) from logistic ($S$) growth; the latter levels off at the carrying capacity ($\frac{dN}{dt}=r_{\max}N\frac{K-N}{K}$).
    • Separate density-dependent (competition, disease, predation) from density-independent (weather) limiting factors.
    • Name community interactions (competition, predation, symbiosis) and the effect of a keystone species.
    • Explain how disturbing one species — especially a keystone or a whole trophic level — ripples through the ecosystem.

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